Dynamic protein ligand interactions - insights from mass spectrometry
2014-01-14
org.kosen.entty.User@6c73d218
김혜은(hyessi)
첨부파일
행사&학회소개
1. Introduction
2. Identifying interactions through proteomics
3. Probing dynamic protein ligand interactions with HX-MS
4. Hydroxyl radical footprinting
5. Probing changes in interface interactions using chemical cross-linking
6. Shapes and sizes from Ion mobility-MS of intact protein complexes
7. Integrating MS data using computational modelling
8. Quantifying lipid binding to membrane protein complexes
9. Nucleic acid or nucleotide binding ? distinguishing specific from non-specific binding
10. Peptide binding ? uncovering mechanistic insights
11. Protein protein interactions ? establishing the correct stoichiometry
12. Drug binding ? defining changes by their effects on subunit interactions and dynamics
13. Concluding remarks
2. Identifying interactions through proteomics
3. Probing dynamic protein ligand interactions with HX-MS
4. Hydroxyl radical footprinting
5. Probing changes in interface interactions using chemical cross-linking
6. Shapes and sizes from Ion mobility-MS of intact protein complexes
7. Integrating MS data using computational modelling
8. Quantifying lipid binding to membrane protein complexes
9. Nucleic acid or nucleotide binding ? distinguishing specific from non-specific binding
10. Peptide binding ? uncovering mechanistic insights
11. Protein protein interactions ? establishing the correct stoichiometry
12. Drug binding ? defining changes by their effects on subunit interactions and dynamics
13. Concluding remarks
보고서작성신청
단백질은 세포의 서로 다른 행동에 대한 미세 조정 및 촉매 코어 등을 형성하기 위하여 탄수화물, 지질 및 핵산의 동적 상호 작용을 받고 있다. 따라서 단백질과 그들의 동족 리간드 사이의 역동적인 상호 작용에 관한 연구는 생물학적 시스템의 이해에 필수적이라 할 수있다. 지난 수 십년간 질량 분석 및 그 관련 기술들이 단백질 리간드 상호 작용의 연구를 위한 방법으로 사용되고 있는데, 그 이유는 질량분석을 이용한 연구법이 단백질의 리간드 상호작용 및 공유/비공유 어셈블리등의 분석에 매우 유용하도록 잘 확립되어 있기 때문이라고 할 수 있다.
본 자료는 단백질 소단위, 약물 분자, 올리고 뉴클레오티드, 탄수화물 및 지질을 포함 하는 리간드의 광범위한 정의를 정립하고, 질량분석기를 이용하여 적절한 조건 하에서 질량 분석 조성물, 이질성 단백질 리간드 상호 작용의 역학 및 구조적 배치 및 결합 친화도를 어떻게 밝히는지 보여준다. 또한 단백질 - 리간드 통합 막 서브 유닛을 포함한 단백질 복합체를 연구하기 위한 접근 방법을 쇼 케이스 예제를 통하여 잘 설명하고 있다. 이 자료를 통하여 질량분석기를 이용한 연구를 수행하는 과학자들이 질량분석기를 통하여 단백질이 상호작용하는 리간드와의 결합에 대한 응답으로 어떤식으로 구조적 변화가 일어나고 미묘한 수정이 일어나는지에 대한 통찰력을 수소 교환, 단백질 체학, 가교등을 포함하는 무수한 방법을 통하여 얻을 수 있을 것이다.
본 자료는 단백질 소단위, 약물 분자, 올리고 뉴클레오티드, 탄수화물 및 지질을 포함 하는 리간드의 광범위한 정의를 정립하고, 질량분석기를 이용하여 적절한 조건 하에서 질량 분석 조성물, 이질성 단백질 리간드 상호 작용의 역학 및 구조적 배치 및 결합 친화도를 어떻게 밝히는지 보여준다. 또한 단백질 - 리간드 통합 막 서브 유닛을 포함한 단백질 복합체를 연구하기 위한 접근 방법을 쇼 케이스 예제를 통하여 잘 설명하고 있다. 이 자료를 통하여 질량분석기를 이용한 연구를 수행하는 과학자들이 질량분석기를 통하여 단백질이 상호작용하는 리간드와의 결합에 대한 응답으로 어떤식으로 구조적 변화가 일어나고 미묘한 수정이 일어나는지에 대한 통찰력을 수소 교환, 단백질 체학, 가교등을 포함하는 무수한 방법을 통하여 얻을 수 있을 것이다.