동향

A survey of best practices for RNA-seq data analysis

행사&학회소개
Background
Experimental design
Analysis of the RNA-seq data
Integration with other data types
Outlook
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RNA 시퀀싱은 생물학 연구에서 다양한 목적으로 사용될 수 있다. 하지만 아직 모든 경우에 적용 가능한 단일 분석 파이프라인은 존재하지 않는다. 본 자료는 실험 디자인, 품질 통제, 서열 조각 배열, 유전자 및 전자체 발현양 측정, 시각화, 발현양 차이 분석, alternative splicing, 기능 분석, 유전자 융합(gene fusion) 탐색, eQTL 매핑 등 RNA-seq 데이터 분석에 사용되는 모든 주요 단계들을 요약 설명하고, 각 단계들에서 아직 해결되지 못한 도전 과제들을 보인다. 또한 작은 RNA(small RNA) 분석 방법 및 다른 유전체 분석 기술과 RNA-seq 데이터 통합 분석 방법에 대해서도 설명한다. 마지막으로 본 자료에서는 전사체 분석에 새로운 전기를 마련할 수 있는 새로운 기술 발전 전망에 대해서도 논한다.