Advances in identification and validation of protein targets of natural products without chemical modification.
2016-06-19
org.kosen.entty.User@6e981a9c
김병규(goldenlion)
분야
생명과학
개최일
11 March 2016.
신청자
김병규(goldenlion)
개최장소
URL
행사&학회소개
1. Introduction
2. Advances in target identi？cation and validation of labelfree
natural products
3.1. Direct methods for target identi？cation of label-free
natural products
3.1.1. Drug affinity responsive target stability (DARTS)
3.1.2. Stability of proteins from rates of oxidation (SPROX)
3.1.3. Cellular thermal shi assay (CETSA)
3.1.4. Thermal proteome pro？ling (TPP)
3.1.5. Pros and cons of direct methods for target identi？cation
of label-free natural products
3.2. Indirect methods of target identi？cation of label-free
natural products
3.2.1. Genetics and genomics based approach
3.2.2. Bioinformatics-based analysis using Connectivity Map
(CMap) application
4. Conclusions and future perspectives
2. Advances in target identi？cation and validation of labelfree
natural products
3.1. Direct methods for target identi？cation of label-free
natural products
3.1.1. Drug affinity responsive target stability (DARTS)
3.1.2. Stability of proteins from rates of oxidation (SPROX)
3.1.3. Cellular thermal shi assay (CETSA)
3.1.4. Thermal proteome pro？ling (TPP)
3.1.5. Pros and cons of direct methods for target identi？cation
of label-free natural products
3.2. Indirect methods of target identi？cation of label-free
natural products
3.2.1. Genetics and genomics based approach
3.2.2. Bioinformatics-based analysis using Connectivity Map
(CMap) application
4. Conclusions and future perspectives
보고서작성신청
천연물의 표적 단백질 규명은 분자 프로브 혹은 잠재적인 치료제 개발에 필수불가결한 과정이다. 일반적으로 천연물을 고정 하여 (immobilized) 결합 크로마토그래피를 통해 단백질을 동정하는 방법이 비교적 좋은 결과를 가져다 주었지만 고정을 하기 위해 천연물에 표지를 하는 경우 종종 천연물의 활성 혹은 표적 단백질에 대한 결합력이 감소되는 단점들이 존재한다. 이를 극복하기 위해 화학적 수식을 하지 않고 천연물 단백질을 동정하는 새로운 전략들이 대두되고 있다. 최근, drug affinity responsive target stability (DARTS), stability of proteins from rates of oxidation (SPROX), cellular thermal shift assay (CETSA), thermal proteome profiling (TPP), 그리고 bioinformatics-based analysis of connectivity 등이 방법들이 개발되어 다양한 천연물 표적 단백질 동정에 적용되고 있다. 본 분석물은 비표지 기반 천연물 표적 단백질 동정에 대한 상기 최신 기법들에 대해 요약 정리하여 관련 연구자들에게 도움이 될 수 있을 것이다.