2020-05-22
org.kosen.entty.User@372c99b
운영자(kosenadmin)
발주처
보건복지부
국가
분야
보건의료,생명과학
접수기간
2020-05-20 ~ 2020-05-29
첨부파일
1. 사업개요
가. 사업명 : 코로나19 바이러스 유전자 검출 시약 최적화 및 대조물질 제조
나. 사업기간: 계약일 ~ 4개월
다. 소요예산: 99,990천원 (부가세 포함)
라. 계약방법: 제한경쟁입찰 및 협상에 의한 계약체결
(국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령 제43조)
2. 추진계획
가. 배경 및 목적
○ 2019년 12월말에 중국 우한시에서 최초 발생후에 전 세계로 급속히 확산되고 있는 코로나19 진단은 유전자 검출검사법인 real-time RT-PCR법이 사용되고 있음
○ 코로나19 발생 초기에 개발하여 사용하고 있는 코로나19 바이러스 유전자 검출검사법의 개선을 통하여 검사결과의 신뢰성과 재현성 강화 추진
- 유전자 검출 검사법의 조건 고도화, 유전자 염기서열 안정된 부위 추가 선정, 검체로부터 바이러스 유전자 추출 여부 판별, 지침상에 제시한 방법에 따른 적합한 검체 채취여부 판별, 실험자 편의성 제공 등의 검사법 개선 추진
나. 주요 사업 내용
○ 코로나19 바이러스 유전자 검출 시약 키트 조건 최적화
- 코로나19 바이러스 유전자검출용 시약의 반응 조건 설정하여 민감도 및 특이도 확보 및 실험자 편의성 제공
○ 코로나19 유전자 검출법의 양성대조물질 생산 및 반응조건 최적화
- RNA 추출 검증물질(RNA extraction control), PCR 반응 검증물질 (Internal positive control) 등의 검증용 대조물질 생산과 반응조건 설정
3. 과업내용
가. 세부 과업 내용
1) 코로나19 바이러스 유전자 검출용 키트 최적화
○ 제공된 프라이머 및 프로브를 이용한 키트 제작 최적화
- 발주처 제공 프라이머 및 프로브의 키트 제작
* WHO GISAID, NCBI genbank 등 유전자 DB에 등재된 전장 유전자 서열 분석하여 검출목표 선정부위의 유전자 염기서열 변이여부 재확인
* 발주처의 기존 민감도, 특이도 동등 이상
- 증폭효율 최적화를 위한 프라이머 농도 검증 및 최적화
- 최적화된 프라이머 농도에 따른 적정 프로브 농도 선정
2) 검체 채취 및 유전자 반응 내부정도 검증물질 최적화
○ 발주부서에서 제공한 검증물질 첨부 및 반응 최적화
- RNA 추출 검증물질(RNA extraction control) 반응 최적화
- 내부정도 검증물질(Internal positive control) 첨부 및 반응 최적화
3) 시약 혼합(프리믹스) 조건 최적화 및 간소화
- 최적화된 프라이머, 프로브, 기타 시약 혼합조건 최적화
- 단일 tube내 반응 조건 설정
4) 발주처에서 제공한 정보에 따라 양성대조물질 제작
○ 증폭목적 유전자를 모두 포함하는 양성대조물질 제작
- 개선된 프라이머, 프로브 증폭부위 검증 및 제작
○ 양성대조물질 교차 오염 검증 부위 삽입
- 양성대조물질에 의한 교차오염 확인 유전자삽입
- 오염 확인 방법 선정 및 최적화
5) 균질성과 안정성이 확보된 양성대조물질 제공
- 납품수량: 1,000 vials씩 완제품으로 포장 납품
* 감염병 실험실검사용 표준물질 생산·관리 안내서에 따라 수행
* 81vials을 한 box단위로 포장하여 납품
- 분주량: 20㎕/vial (협의 가능)
6) 최소검출한계(LOD, Limit of detection) 산출
- promoter와 RNA transcriptase를 이용하여 RNA transcript 합성
- 합성 RNA를 이용하여 최소검출한계 검증 및 표준곡선 산출
7) 최종보고서 및 최적화제품 제공
- 코로나19 유전자 검사시약 시제품 1,000 test 분량 납품
** 자세한 내용은 바로가기(URL)와 첨부파일을 통해 확인하시기 바랍니다.
나. 사업기간: 계약일 ~ 4개월
다. 소요예산: 99,990천원 (부가세 포함)
라. 계약방법: 제한경쟁입찰 및 협상에 의한 계약체결
(국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령 제43조)
2. 추진계획
가. 배경 및 목적
○ 2019년 12월말에 중국 우한시에서 최초 발생후에 전 세계로 급속히 확산되고 있는 코로나19 진단은 유전자 검출검사법인 real-time RT-PCR법이 사용되고 있음
○ 코로나19 발생 초기에 개발하여 사용하고 있는 코로나19 바이러스 유전자 검출검사법의 개선을 통하여 검사결과의 신뢰성과 재현성 강화 추진
- 유전자 검출 검사법의 조건 고도화, 유전자 염기서열 안정된 부위 추가 선정, 검체로부터 바이러스 유전자 추출 여부 판별, 지침상에 제시한 방법에 따른 적합한 검체 채취여부 판별, 실험자 편의성 제공 등의 검사법 개선 추진
나. 주요 사업 내용
○ 코로나19 바이러스 유전자 검출 시약 키트 조건 최적화
- 코로나19 바이러스 유전자검출용 시약의 반응 조건 설정하여 민감도 및 특이도 확보 및 실험자 편의성 제공
○ 코로나19 유전자 검출법의 양성대조물질 생산 및 반응조건 최적화
- RNA 추출 검증물질(RNA extraction control), PCR 반응 검증물질 (Internal positive control) 등의 검증용 대조물질 생산과 반응조건 설정
가. 세부 과업 내용
1) 코로나19 바이러스 유전자 검출용 키트 최적화
○ 제공된 프라이머 및 프로브를 이용한 키트 제작 최적화
- 발주처 제공 프라이머 및 프로브의 키트 제작
* WHO GISAID, NCBI genbank 등 유전자 DB에 등재된 전장 유전자 서열 분석하여 검출목표 선정부위의 유전자 염기서열 변이여부 재확인
* 발주처의 기존 민감도, 특이도 동등 이상
- 증폭효율 최적화를 위한 프라이머 농도 검증 및 최적화
- 최적화된 프라이머 농도에 따른 적정 프로브 농도 선정
2) 검체 채취 및 유전자 반응 내부정도 검증물질 최적화
○ 발주부서에서 제공한 검증물질 첨부 및 반응 최적화
- RNA 추출 검증물질(RNA extraction control) 반응 최적화
- 내부정도 검증물질(Internal positive control) 첨부 및 반응 최적화
3) 시약 혼합(프리믹스) 조건 최적화 및 간소화
- 최적화된 프라이머, 프로브, 기타 시약 혼합조건 최적화
- 단일 tube내 반응 조건 설정
4) 발주처에서 제공한 정보에 따라 양성대조물질 제작
○ 증폭목적 유전자를 모두 포함하는 양성대조물질 제작
- 개선된 프라이머, 프로브 증폭부위 검증 및 제작
○ 양성대조물질 교차 오염 검증 부위 삽입
- 양성대조물질에 의한 교차오염 확인 유전자삽입
- 오염 확인 방법 선정 및 최적화
5) 균질성과 안정성이 확보된 양성대조물질 제공
- 납품수량: 1,000 vials씩 완제품으로 포장 납품
* 감염병 실험실검사용 표준물질 생산·관리 안내서에 따라 수행
* 81vials을 한 box단위로 포장하여 납품
- 분주량: 20㎕/vial (협의 가능)
6) 최소검출한계(LOD, Limit of detection) 산출
- promoter와 RNA transcriptase를 이용하여 RNA transcript 합성
- 합성 RNA를 이용하여 최소검출한계 검증 및 표준곡선 산출
7) 최종보고서 및 최적화제품 제공
- 코로나19 유전자 검사시약 시제품 1,000 test 분량 납품
** 자세한 내용은 바로가기(URL)와 첨부파일을 통해 확인하시기 바랍니다.