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동향

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16S rRNA gene high-throughput sequencing data mining of microbial diversity and interactions

2017-08-21 org.kosen.entty.User@3f3829e6 김중재(jjkaos)

발행기관

Feng Ju, Tong Zhang

발행일

MAY 2015

URL

http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00253-015-6536-y

미생물은 오래전부터 우리의 생활에 밀접한 관련을 가져 왔으며, 그 활용도가 식품, 환경, 에너지, 의료 분야 등으로 확장되며 많은 관심을 받고 있습니다. 이러한 미생물을 분류하고 동정하기위해 16S rRNA 유전자의 염기서열을 분석하는 방법이 사용되어 오고 있는데, 최근 DNA 염기서열 분석 방법의 비약적인 발전으로 인해 특정 환경의 미생물군 전체를 분석하고 그 상호작용을 연구하려는 노력이 시도되고 있습니다. 하지만, 소수의 염기서열을 분석하는 것과는 달리 대량의 정보를 신속히 분석하기 위해서는 발달된 생물정보학적 기술이 필요하며, 잘 정리된 분석 pipeline 이 필요합니다. 본 자료는 이러한 대용량 염기서열을 분석하여 미생물의 다양성과 그 상호작용을 연구하기 위하여 필요한 과정을 실질적인 예를 들어 단계별로 잘 정리하고 있습니다. 이러한 자료는 16S rRNA 유전자를 대상으로 차세대 염기서열 분석 (Next generation sequencing) 을 시작하려는 연구자들에게 길잡이를 제공해 줄 것이며, 기존의 연구자들에게는 폭넓은 접근 방법을 제시해 줄 것으로 판단되어 본 자료를 추천합니다.
김중재

김중재(jjkaos)

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