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아래는 http://biozine.kribb.re.kr/에서 발췌한 기사입니다. 참고하시기 바랍니다. Toxicogenomics 시대를 연다 (2000. 11.) 30억 base-pair의 인간 genome 염기서열을 완전히 해독하게 되었다. 이 genome속에는 약 80,000개의 유전자로 구성되어 있는데 전체의 유전자 기능을 해석하는데 있어서 현재의 생명공학기술을 생물학에 도입한 electronic biology가 새롭게 탄생하였으며 postgenome 시대에 접어들게 된 것이다. 바로 DNA chip의 개발이 그것이다. 이 기술은 기초생명공학 뿐 만 아니라 병의 진단, 신약개발의 촉진, 그리고 인체정보에 대한 database의 구축등에 크게 공헌하게 될 것이다. 최근 이 DNA chip이 독성학연구에 접목하는 것에 의해서 toxicogenomics라 부르는 새로운 학문의 장이 열리고 있다. Toxicogenomics의 탄생은 처음 미 NIEHS에 급속히 영향을 주어 ToxChip을 개발하게 되었고 미 FDA에서도 이의 적용을 적극적으로 권유하고 있는 실정이다. 본란에서는 이 DNA 기술에 대한 개념과 독성학에의 적용할 필요성을 기술하고자 한다. DNA chip은 붙이는 유전물질의 크기에 따라 cDNA chip 및 oligonucleotide chip으로 나뉘는데 본란에서는 dDNA chip에 속하는 cDNA microarray에 대해서 논한다. 이 cDNA microarray는 수많은 유전자를 기계자동화와 전자제어 기술등을 이용하여 slide glass나 nitrocellulose 위의 아주 작은 공간안에 붙여 놓은 것이다. 이 glass slide는 poly-L-lysine으로 처리되어 유전자들과 쉽게 결합할 수 있다. 처리된 microarray chip은 각각 다른 환경에서 특이적으로 발현되는 수천개 이상의 유전자 발현을 분석하는데 이용할 수 있다. 이는 서로 다른 두군의 환경(대조군과 실험군)에서 자란 세포로부터 추출한 mRNA를 template로 하여 RT enzyme에 의해서 역전사 시킬 때 각각 다른 색의 형광물질을 띤 염기서열이 투입되어 빨간색(Cy5)인 녹색(Cy3)을 띤 cDNA가 합성된다. 이와 같이 합성된 두 군의 cDNA를 같은 양으로 섞어서 cDNA microarray에 결합시킨다. 이때 결합이 안된 유전자를 씻어낸 chip은 laser fluorocence scanner에 의해서 읽혀진다. 이때 녹색은 대조군에서 빨간색은 실험군에서만 특이하게 발현되는 유전자의 활성정도를 나타내게 되며 노란색은 녹색과 빨간색의 보라색으로 두 군에서 큰 차이가 없음을 의미한다. 그러면 어떻게 독성연구에 적용할 수 있을 것인가? 현재 87,000여종에 이른 화학물질의 독성평가를 동물사용에 의존하고 있다. 앞으로는 특정 독성물질에 의해서 영향을 받고 있는 수천종의 유전자 가운데서 어느 유전자가 발현이 증가되고 억제되는지를 알 수 있다. 가령, dioxin의 미처리 및 처리 군에서 mRNA를 추출하여 위와 같은 방법으로 형광의 색정도에 의해서 측정할 수 있다. 현재는 인간의 많은 유전자를 slide glassd에 심을 수 없기 때문에 부분적으로 행하고 있다. 앞으로 microarray는 chemical을 screening 하는데 곧 보편화 되리라고 믿는다. 미 NIEHS의 ToxChip 개발에서 보듯이 우리도 새로운 변화에 도전 할 때가 온 것이다. -----------------------------김용규 -국립독성연구소 신경독성과 - 아래의 자료는 참고자료가 될만한 자료의 서지사항입니다. 아쉽지만 한글문서로 된 toxicogenomics관련 자료를 찾기는 쉽지 않았습니다. 개인저자 Nuwaysir, Emile F ; Bittner, Michael ; Trent, Jeffrey ; Barrett, J Carl ; Afshari, Cynthia A 논 문 명 In Perspective - Mieroarrays and Toxicology: The Advent of Toxicogenomics / 발행사항 1999 형태사항 7 p. 제어번호 1081387 자료형태 기사 게재지명 Molecular Carcinogenesis 권호명 v.24 no.3 (p.153-159) 논문명 Toxicogenomics - Toxicologists brace for genomics revolution 저자명 Lovett RA. 출처 Science , V.289 N.5479 , 536-537 , 20000728 PUBLISHER(Country) AAAS (us ) LANGUAGE eng ISSN 0036-8075 >최근 독성학 분야에서 > >microarrays를 이용한 독성측정에 분자생물학을 이용하는 > >것으로 알고 있습니다 > >그러한 분야가 바로 toxicogenomics라고 알고 있는데 > >이것에 대해 좀더 자세히 알고 싶습니다 > >예를 들면 기술개요, 국내외 기술동향, 시장성 등에 > >대해 알수 있으면 합니다 > >아무래도 제가 잘 모르는 분야니까 > >한글문서면 더욱 좋겠습니다 > >감사합니다 > >

최근 학계에서 발표된 관련 논문의 초록입니다. 참고하십시요. Application of genomics to the definition of the molecular basis for toxicity William D. Pennie, , Nicola J. Woodyatt, Tom C. Aldridge and George Orphanides Syngenta Central Toxicology Laboratory, Macclesfield, Cheshire, SK10 4TJ, UK Available online 19 April 2001. Abstract Transcript profiling technology enables quantitative measurement of the transcriptional activity of potentially thousands of genes in biological samples. The application of such technology to toxicology, toxicogenomics, promises substantial dividends in mechanistic toxicity research and also, possibly, the ability to predict adverse toxicity for novel or untested compounds. Our laboratory has developed a custom approach to this technology, designing cDNA microarray platforms specifically for gene expression events of relevance to a large number of toxicological endpoints. Such arrays allow comprehensive coverage of genes associated with entire pathways (such as oxidative stress, signal transduction, stress response, epithelial biology) and enable simultaneous measurement of more than ten thousand gene expression events. Author Keywords: Transcript profiling; Toxicogenomics; Receptor biology Pharmacogenomics: The genomics of drug response March R. Research and Development Genetics, Astra Zeneca, Mereside, Alderley Park, Macclesfield, Cheshire SK10 4TG, UK Abstract Pharmacogenomics is defined as the study of the association between genetics and drug response. This is a rapidly expanding field with the hope that, within a few years, prospective genotyping will lead to patients being prescribed drugs which are both safer and more effective ('the right drug for the right patient', or personalized medicine). There are many existing examples in the literature of strong associations between genetic variation and drug response, and some of these even form the basis of accepted clinical tests. The molecular basis for some of these associations is described, and includes examples of variation in genes responsible for absorption and metabolism of the drug, and in target and disease genes. However, there are many issues surrounding the legal, regulatory and ethical framework to these studies that remain unanswered, and a huge amount of education both for the public and healthcare professionals will be needed before the results of this new medicine can be widely accepted. Copyright (C) 2000 John Wiley and Sons, Ltd. [Journal Review; In English; Summary in English] Author Keywords: Pharmacogenomics; Pharmacogenetics; Toxicogenomics; Drug response; Adverse events; Personalized medicine Index Terms: pharmacogenomics; drug response; new drug >최근 독성학 분야에서 > >microarrays를 이용한 독성측정에 분자생물학을 이용하는 > >것으로 알고 있습니다 > >그러한 분야가 바로 toxicogenomics라고 알고 있는데 > >이것에 대해 좀더 자세히 알고 싶습니다 > >예를 들면 기술개요, 국내외 기술동향, 시장성 등에 > >대해 알수 있으면 합니다 > >아무래도 제가 잘 모르는 분야니까 > >한글문서면 더욱 좋겠습니다 > >감사합니다 > >

toxicogenomics에 관한 입문 지식을 제공하는 링크를 참조하세요. > >microarrays를 이용한 독성측정에 분자생물학을 이용하는 > >것으로 알고 있습니다 > >그러한 분야가 바로 toxicogenomics라고 알고 있는데 > >이것에 대해 좀더 자세히 알고 싶습니다 > >예를 들면 기술개요, 국내외 기술동향, 시장성 등에 > >대해 알수 있으면 합니다 > >아무래도 제가 잘 모르는 분야니까 > >한글문서면 더욱 좋겠습니다 > >감사합니다 > >