2001-08-05
org.kosen.entty.User@230501ab
공원식(wskong@)
- 3
수고하십니다.
농과원의 공원식입니다.
외국의 버섯 바이러스 연구 동향과 참고문헌을 얻고 싶습니다.
주로 영국이나 네델란드에서는 양송이(Agaricus) 바이러스에 대한 연구가 많이 진행되어 있는데 특히 EM 이나 ISEM 또는 PAGE에 의한 바이러스 검출 및 유전체에 관한 자료를 구할 수 있을까 해서 부탁드립니다.
지난 번에도 좋은 정보를 얻었기에 이번에도 기대가 큽니다.
수고하세요.
wskong@rda.go.kr
지식의 출발은 질문, 모든 지식의 완성은 답변!
각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
답변 3
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답변
박철호님의 답변
2001-08-21- 0
Below are abstracts of articles on the identification and genome structure of mushroom bacilliform virus ( RNA virus of Agaricus bisporus). You will find a URL address which contains complete genome information of Mushroom bacilliform virus at the end of the article list. Good luck! 1. Virology 1999 Aug 1;260(2):273-6 Identification of a subgenomic mRNA encoding the capsid protein of mushroom bacilliform virus, a single-stranded RNA mycovirus. Revill PA, Davidson AD, Wright PJ. Department of Microbiology, Monash University, Clayton, Victoria, 3168, Australia. Mushroom bacilliform virus is unique among mycoviruses of the higher fungi in having a genome of positive-sense single-stranded RNA. We have identified a subgenomic mRNA molecule encoding the viral capsid protein in mushroom bacilliform virus-infected mycelium of Agaricus bisporus. Transcription of subgenomic RNA commences at the sequence ACAAAA, 47 nucleotides upstream of the initiating AUG. Copyright 1999 Academic Press. 2. Virology 1998 Sep 30;249(2):231-7 Mushroom bacilliform virus RNA: the initiation of translation at the 5' end of the genome and identification of the VPg. Revill PA, Davidson AD, Wright PJ. Department of Microbiology, Monash University, Wellington Rd., Clayton, Victoria, 3168, Australia. peter.revill@med.monash.edu.au Mushroom bacilliform virus (MBV) is often found in cultivated mushrooms (Agaricus bisporus) with La France disease. MBV has a 4-kb ssRNA genome of positive-sense encoding four major open reading frames (ORFs). The arrangement of ORFs at the 5' end of the genome and the deduced amino-acid sequences of two of the putative gene products (protease and RNA-dependent RNA polymerase) show remarkable similarity to some plant viruses, particularly subgroup II luteoviruses. We show that this similarity extends to the translation strategy at the 5' end of the genome, the presence of a genome-linked protein (VPg), and the location of the VPg downstream of the protease motifs in the polypeptide encoded by ORF2. Copyright 1998 Academic Press. 3. Appl Environ Microbiol 1995 Jun;61(6):2322-5 PCR analysis of the viral complex associated with La France disease of Agaricus bisporus. Romaine CP, Schlagnhaufer B. Department of Plant Pathology, Pennsylvania State University, University Park 16802, USA. Reverse transcription PCR analysis was used to investigate the involvement of two RNA-genome viruses, La France isometric virus (LIV) and mushroom bacilliform virus (MBV), in the etiology of La France disease of the cultivated mushroom Agaricus bisporus. Reverse transcription PCR amplification of sequences targeted to the genomes of LIV and MBV, with a sensitivity of detection of < 10 fg of viral RNA, showed diseased mushrooms to be either singly infected by LIV or doubly infected by LIV and MBV. Of 70 geographically diverse diseased mushroom isolates, 100% were infected by LIV, whereas almost 60% of these isolates were coinfected by MBV. Of 58 mushroom isolates determined to be free of infection by LIV, 3 were found to be infected by MBV. This represents the first documented report of the independent replication of these two viruses. Our data support the hypothesis that La France disease is associated with infection by two autonomously replicating viruses in which LIV is the primary causal agent and MBV, although possibly pathogenic and capable of modulating symptoms, is not required for pathogenesis. 4. Virology 1994 Aug 1;202(2):904-11 The nucleotide sequence and genome organization of mushroom bacilliform virus: a single-stranded RNA virus of Agaricus bisporus (Lange) Imbach. Revill PA, Davidson AD, Wright PJ. Department of Microbiology, Monash University, Clayton, Victoria, Australia. Mushroom bacilliform virus (MBV) is found in association with spherical virus-like particles in cultivated mushrooms (Agaricus bisporus) afflicted with La France disease. MBV possesses a monopartite ssRNA genome of positive sense and differs from the majority of characterized mycoviruses, which contain segmented dsRNA genomes. We have cloned and sequenced the MBV genome and determined that its length is 4009 nucleotides. The MBV genome contains four major and three minor open reading frames and has 5' and 3' noncoding regions of 60 and 250 nucleotides, respectively. The putative RNA-dependent RNA polymerase and the coat protein display homology with corresponding proteins encoded by certain plant viruses, particularly luteoviruses and carmoviruses. Below website contains complete genome information of Mushroom bacilliform virus. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/htbin-post/Entrez/query?db=n&p&form=6&Dopt=g&uid=U07551 >수고하십니다. >농과원의 공원식입니다. >외국의 버섯 바이러스 연구 동향과 참고문헌을 얻고 싶습니다. >주로 영국이나 네델란드에서는 양송이(Agaricus) 바이러스에 대한 연구가 많이 진행되어 있는데 특히 EM 이나 ISEM 또는 PAGE에 의한 바이러스 검출 및 유전체에 관한 자료를 구할 수 있을까 해서 부탁드립니다. >지난 번에도 좋은 정보를 얻었기에 이번에도 기대가 큽니다. >수고하세요. > >wskong@rda.go.kr -
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박종원님의 답변
2001-08-24- 0
공원식 선생님 먼저 kiho님께서 보내주신것을 참고하시구요. 그리고 아래 사이트는 PAGE 에 대한 내용입니다. 참고하시기 바랍니다. 한국에서는 다음 사이트에서 좋은 자료와 관련 사이트를 보실수가 있습니다. 또는 그곳으로 문의하시면 더욱 좋은 정보를 얻으실 수 있습니다. http://www.proteomix.org/ 를 참고하세요. 그리고 첨부 파일은 PAGE 실험법입니다. 위의 사이트에서 다운받은것이지요.. >수고하십니다. >농과원의 공원식입니다. >외국의 버섯 바이러스 연구 동향과 참고문헌을 얻고 싶습니다. >주로 영국이나 네델란드에서는 양송이(Agaricus) 바이러스에 대한 연구가 많이 진행되어 있는데 특히 EM 이나 ISEM 또는 PAGE에 의한 바이러스 검출 및 유전체에 관한 자료를 구할 수 있을까 해서 부탁드립니다. >지난 번에도 좋은 정보를 얻었기에 이번에도 기대가 큽니다. >수고하세요. > >wskong@rda.go.kr -
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박종원님의 답변
2001-08-31- 0
ISEM 에 대한 분석방법과 예가 있는 자료입니다. 참고가 될 겁니다. http://chunma.yeungnam.ac.kr/~a9940160/education.htm 에서 3.Two viruses isolated from Yam in Korea 을 click하여 보시면 중간에 ELECTRON MICROSCOPIC EXAMINATION(ISEM) 에 대한 설명이 있구요 TEM을 click하시면 분석과정이 나옵니다. >수고하십니다. >농과원의 공원식입니다. >외국의 버섯 바이러스 연구 동향과 참고문헌을 얻고 싶습니다. >주로 영국이나 네델란드에서는 양송이(Agaricus) 바이러스에 대한 연구가 많이 진행되어 있는데 특히 EM 이나 ISEM 또는 PAGE에 의한 바이러스 검출 및 유전체에 관한 자료를 구할 수 있을까 해서 부탁드립니다. >지난 번에도 좋은 정보를 얻었기에 이번에도 기대가 큽니다. >수고하세요. > >wskong@rda.go.kr