2004-07-20
org.kosen.entty.User@160bfb0a
김현경(qqkd007)
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제게는 너무나 생소하기에..
이렇게 전문가 회원님의 도움을 청합니다.
제가 공부하고 있는 transcription factor의 조절에 DNA metylation이 관여되는 지를 확인해 보고 싶습니다.
이는 이미 이 transcription factor가 acetylation에 의해 조절되어진다는 보고가 있었기에, metylation역시도 관여되지 않을까하는 궁금함에서 시작되었으나,
그 궁금점을 풀 방법이 전혀 감이 오지않아..
이렇게 연락드리는 것입니다.
제게 도움을 주셨으면 합니다.
- DNA metylation
- trnascription
- acetylation
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 3
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답변
전주홍님의 답변
2004-07-20- 0
dna methylation은 methylation-specific pcr 기법으로 쉽게 확인하는 방법이 있습니다. 국내 벤쳐회사인 in2gen (www.in2gen.com) 이란 회사에서 키트화를 시킨 제품이 있구요. 현재 판매는 성우라이프사이언스 (www.sungwools.com) 라는 회사에서 맡고 있습니다. 회사 홈페이지에서 확인해보시면 아마 해답을 얻을 수 있을 것도 같네요... 수고하세요... >제게는 너무나 생소하기에.. >이렇게 전문가 회원님의 도움을 청합니다. >제가 공부하고 있는 transcription factor의 조절에 DNA metylation이 관여되는 지를 확인해 보고 싶습니다. >이는 이미 이 transcription factor가 acetylation에 의해 조절되어진다는 보고가 있었기에, metylation역시도 관여되지 않을까하는 궁금함에서 시작되었으나, >그 궁금점을 풀 방법이 전혀 감이 오지않아.. >이렇게 연락드리는 것입니다. >제게 도움을 주셨으면 합니다. -
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박인영님의 답변
2004-07-20- 0
>제게는 너무나 생소하기에.. >이렇게 전문가 회원님의 도움을 청합니다. >제가 공부하고 있는 transcription factor의 조절에 DNA metylation이 관여되는 지를 확인해 보고 싶습니다. >이는 이미 이 transcription factor가 acetylation에 의해 조절되어진다는 보고가 있었기에, metylation역시도 관여되지 않을까하는 궁금함에서 시작되었으나, >그 궁금점을 풀 방법이 전혀 감이 오지않아.. >이렇게 연락드리는 것입니다. >제게 도움을 주셨으면 합니다. histone deacetylation은 TSA 처리로 그 유전자의 발현이 증가하게 되면 그 유전자의 promoter 부분이 deacetylation되어 있다고 알 수 있듯이 5'-azadeoxycytidine을 처리하면 그 유전자의 promoter가 DNA methylation으로 인해 repression되고 있다는 것을 알 수 있습니다. 원하는 transcription factor의 binding site를 DNA methylation시키고 EMSA를 했을 때 binding 못 한다면 methylation으로 인해 그 transcription factor가 작용못한다는 것을 알 수 있죠. 질문의 뉘앙스가 transcription factor 자체에 acetylation된다는 것인 지 의문스럽습니다. 단백질에 methylation되는 것은 histone을 비롯한 극히 일부 단백질에서만 알려져있습니다. 이 문제는 chromatin IP 같이 전혀 다른 방법으로 실험해야 합니다. -
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박진아님의 답변
2004-10-19- 0
TF의 expression이 promoter acetylation에 의한 것이라고 알려졌고, 혹시나 이 factor의 promoter가 methylation되었는지 알고 싶으신건가요? 질문이 구체적이지 않아 적절한 답변이 될런지요.. 가장 쉽게 위에서 답변해주신 5-aza drug를 3~5day사이 처리하시고 cDNA를 만들어서 그 TF를 RT-PCR하는 방법이 있습니다. PCR에서 control cell(DMSO처리)에는 안보이던 band가 5-aza처리된 cell에서만 보인다면 그것은 methylation에 의해 gene expression이 down된것 입니다. >제게는 너무나 생소하기에.. >이렇게 전문가 회원님의 도움을 청합니다. >제가 공부하고 있는 transcription factor의 조절에 DNA metylation이 관여되는 지를 확인해 보고 싶습니다. >이는 이미 이 transcription factor가 acetylation에 의해 조절되어진다는 보고가 있었기에, metylation역시도 관여되지 않을까하는 궁금함에서 시작되었으나, >그 궁금점을 풀 방법이 전혀 감이 오지않아.. >이렇게 연락드리는 것입니다. >제게 도움을 주셨으면 합니다.