2004-10-28
org.kosen.entty.User@5fdbbfeb
박진우(jinu1115)
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gram-negative bacteria가 분비해서 gram-positive bacteria를 죽이는 물질이 gramicidin 이라고 알고 있습니다.
박테리아 세포막에 channel을 형성해서 물이나 양이온들의 permeability를 증가시켜서 세포를 죽게 만든다고 알고 있는데요...
Gramicidin A의 2차 구조가 helical dimer 와 double helix, 이렇게 2가지 라는데, 논문을 보다보니...
right-handed 인 것도 있고, left-handed인것도 있고, double helix 구조 안에서도 parallel, anti-parallel인것도 있고...굉장히 여러가지더라구요...
그래서 궁금한게,
1. HD, DH 모두 β-helix인지요? pdb파일 받아서 cartoon표시 해보니깐(PyMOL프로그램에서) DH는 β-helix로 표시되는데 반해, HD는 가는 선(loop?)으로만 나타나길래요..
2. 그리고 정말 알고 싶은 것은요.. 어떨 때 DH로 존재하고, 어떤 환경에서 HD로 존재하는지 궁금합니다. HD와 DH간에 transition이 일어나는 건지, 박테리아에서 분비할 때는 어떤 구조로 분비하는지...등 알고싶네요...
- Gramicidin
- ion channel
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