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membrane surface antigen만 검출하는 western blot 방법 또는 자료

hiv가 세포내에서 증식 후 release 될 때 세포막 바깥쪽으로 gp41이 나타날 것입니다. 이 때 mutant virus 중에 세포막 바깥쪽으로 나가지 않는 것이 있는데, 이를 위해서 membrane에 나오는 Ag에 대해서 western을 할려고 합니다. 그런데, 세포내 골지나 ER 및 세포질, 그리고 supernatant에 있는 gp41과 구분해서(즉 fraction을 나눠서) western을 할려고 하는데, 이런 유사한 방법의 논문이나 방법을 구할려고 합니다. 갖고 계시는 분 계신가요?
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답변 2
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    전주홍님의 답변

    잘아시는 내용일 것 같지만 원론적으로는 homogenization, centrifugation, density gradient centrifugation으로 연결되는 방법으로 compartment specific marker를 이용하여 western blot이나 효소활성측정들을 통해 적정 fraction을 골라내는 것인데 참 쉽지만은 않은 실험 기법이지 않나 생각됩니다. 직접적인 답변이 못되어서 죄송하고 참고가 될지는 모르겠지만 첨부파일 올리겠습니다. >hiv가 세포내에서 증식 후 release 될 때 세포막 바깥쪽으로 gp41이 나타날 것입니다. 이 때 mutant virus 중에 세포막 바깥쪽으로 나가지 않는 것이 있는데, 이를 위해서 membrane에 나오는 Ag에 대해서 western을 할려고 합니다. >그런데, 세포내 골지나 ER 및 세포질, 그리고 supernatant에 있는 gp41과 구분해서(즉 fraction을 나눠서) western을 할려고 하는데, 이런 유사한 방법의 논문이나 방법을 구할려고 합니다. > >갖고 계시는 분 계신가요?
    잘아시는 내용일 것 같지만 원론적으로는 homogenization, centrifugation, density gradient centrifugation으로 연결되는 방법으로 compartment specific marker를 이용하여 western blot이나 효소활성측정들을 통해 적정 fraction을 골라내는 것인데 참 쉽지만은 않은 실험 기법이지 않나 생각됩니다. 직접적인 답변이 못되어서 죄송하고 참고가 될지는 모르겠지만 첨부파일 올리겠습니다. >hiv가 세포내에서 증식 후 release 될 때 세포막 바깥쪽으로 gp41이 나타날 것입니다. 이 때 mutant virus 중에 세포막 바깥쪽으로 나가지 않는 것이 있는데, 이를 위해서 membrane에 나오는 Ag에 대해서 western을 할려고 합니다. >그런데, 세포내 골지나 ER 및 세포질, 그리고 supernatant에 있는 gp41과 구분해서(즉 fraction을 나눠서) western을 할려고 하는데, 이런 유사한 방법의 논문이나 방법을 구할려고 합니다. > >갖고 계시는 분 계신가요?
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    김성원님의 답변

    >hiv가 세포내에서 증식 후 release 될 때 세포막 바깥쪽으로 gp41이 나타날 것입니다. 이 때 mutant virus 중에 세포막 바깥쪽으로 나가지 않는 것이 있는데, 이를 위해서 membrane에 나오는 Ag에 대해서 western을 할려고 합니다. >그런데, 세포내 골지나 ER 및 세포질, 그리고 supernatant에 있는 gp41과 구분해서(즉 fraction을 나눠서) western을 할려고 하는데, 이런 유사한 방법의 논문이나 방법을 구할려고 합니다. > >갖고 계시는 분 계신가요? 재밋는 실험 같습니다. 다른 분께서 말씀하신 텍스트적 방법이 처음 떠올랐지만 그나마 쉽지 않다고 하시니... 그냥 anti-gp41 mAb를 먼저 세포에 처리한 후, 그것을 얻어서 간접적으로 보시면 안될까요..? 아니면 어짜피 다른 organelle들은 intact하게 얻지 않아도 되니 용혈시켜 고스트 셀을 만들어 (아마 ultrafiltration으로 얻을 수 있을 것 같은데요) Western을 하시는 것은 어떨까요..? 전문가가 아니라 그냥 의견만 적는 것입니다. 방법을 알아내신 후, 여기에 게시해 주시면 감사하겠습니다.
    >hiv가 세포내에서 증식 후 release 될 때 세포막 바깥쪽으로 gp41이 나타날 것입니다. 이 때 mutant virus 중에 세포막 바깥쪽으로 나가지 않는 것이 있는데, 이를 위해서 membrane에 나오는 Ag에 대해서 western을 할려고 합니다. >그런데, 세포내 골지나 ER 및 세포질, 그리고 supernatant에 있는 gp41과 구분해서(즉 fraction을 나눠서) western을 할려고 하는데, 이런 유사한 방법의 논문이나 방법을 구할려고 합니다. > >갖고 계시는 분 계신가요? 재밋는 실험 같습니다. 다른 분께서 말씀하신 텍스트적 방법이 처음 떠올랐지만 그나마 쉽지 않다고 하시니... 그냥 anti-gp41 mAb를 먼저 세포에 처리한 후, 그것을 얻어서 간접적으로 보시면 안될까요..? 아니면 어짜피 다른 organelle들은 intact하게 얻지 않아도 되니 용혈시켜 고스트 셀을 만들어 (아마 ultrafiltration으로 얻을 수 있을 것 같은데요) Western을 하시는 것은 어떨까요..? 전문가가 아니라 그냥 의견만 적는 것입니다. 방법을 알아내신 후, 여기에 게시해 주시면 감사하겠습니다.
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