2004-12-29
org.kosen.entty.User@7011cd23
심기석(ksangelo)
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neuron이나 glial 또는 oligodendrocyte에서
proteomic를 이용하여 transcription factor 같은
low abundant protein detection 하는 방법으로
실제로 어떤 방법이 쓰이고 있나요.
- proteomic
- transcription factor
- neuron
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답변 1
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답변
김성환님의 답변
2004-12-29- 0
>neuron이나 glial 또는 oligodendrocyte에서 >proteomic를 이용하여 transcription factor 같은 >low abundant protein detection 하는 방법으로 >실제로 어떤 방법이 쓰이고 있나요. > ICAT이란 방법이 쓰일 수도 있구요.. ICAT이란 reagent 하나는 hydrogen (light)으로 다른 하나는 deuterium (heavy)로 label되어 있는데 이를 이용하여 control과 샘플을 각각 labeling하고 HPLC로 분석하면 8da차이가 나면서 peak의 크기가 차이나는 단백질을 찾아낼 수 있습니다만 단점으로는 ICAT reagent는 cystein residue가 있는 단백질하고만 반응한답니다. 최근에는 FFE라고 하여 free-flow electrophoresis. fractionation을 미리하여 2D를 하는 것이죠. 단점은 처음 시작하는 단백질양이 1mg이상되어야 한다는 겁니다. 그리고 PF(protein fraction) 2D도 있는데 이는 HPLC를 이용하여 protein pattern을 비교하면서 fractionation하는 것입니다. 최근에는 이 방법을 많이 사용하고 있다고 하네요. 이러한 방법이 고안된 이유는 생체내에서 중요한 역할을 하는 low abundant protein을 detection하기 위함입니다.