2005-03-04
org.kosen.entty.User@6cf63fca
이현정(endeavor)
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안녕하세요~
궁금한게 있어 이렇게 한걸음에 달려왔습니다.
다른게 아니라 amino acid sequence를 이용해 domain search를 하려고 하는데 괜찮은 사이트 없나요?
NCBI에서 blast search를 해봤거든요,,,
다른 사이트에서도 다시 한번 검증을 해보고 싶은데 괜찮은 사이트 있으면 알려주세요~~
그럼 답변 기다릴게요~
좋은 하루 보내시길.... 햇살이 아주 좋네요^^
- protein domain search
- domain search site
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 2
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답변
전주홍님의 답변
2005-03-04- 0
NCBI의 CDD (Conserved Domain Database) 이외에 EXPASY (www.expasy.org)에서 찾아보실 수 있습니다. EXPASY -> Tools and software packages -> Pattern and profile searches 에 가시면 SMART를 비롯한 여러가지 Domain 관련 사이트를 모아두었습니다. >안녕하세요~ > >궁금한게 있어 이렇게 한걸음에 달려왔습니다. >다른게 아니라 amino acid sequence를 이용해 domain search를 하려고 하는데 괜찮은 사이트 없나요? >NCBI에서 blast search를 해봤거든요,,, >다른 사이트에서도 다시 한번 검증을 해보고 싶은데 괜찮은 사이트 있으면 알려주세요~~ >그럼 답변 기다릴게요~ > > >좋은 하루 보내시길.... 햇살이 아주 좋네요^^ -
답변
최인걸님의 답변
2005-03-04- 0
Pfam(http://www.sanger.ac.uk/Software/Pfam/)이 도메인 검색으로는 가장 대중적으로 사용되고 있습니다. 서열검색도 가능하고, 일단 Blast에서 검색결과가 있으면, 키워드를 사용하여 관련 도메인을 찾아 보실수 있습니다. Pfam검색후에는 검색결과가 제공하는 관련링크(ex. interpro)를 찾아보시면, 도메인과 관련된 정보들을 얻으실수 있습니다.