2005-06-02
org.kosen.entty.User@67f39f72
김리라(lilakim)
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안녕하세요.
protein structure or function 에 대한 질문입니다.
제가 연구하고 있는 protein에 serine rich domain이 2개 정도 있는데, pattern search를 하면 항상 나오더군요.
이 부분이 어떤 역할을 하는 지 혹시 아시는지요.
- protein
- serine-rich domain
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 1
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답변
전주홍님의 답변
2005-06-02- 0
많은 단백질들이 low-complexity region이라고 부르는 compositionally biased sequence region을 가지고 있습니다. 이러한 region에는 하나 또는 두가지 종류의 아미노산이 enrich 된 경우가 많습니다. 그러므로 특정 부위의 아미노산 구성을 기반으로 불리어 지기 때문에 기능이나 역할과 결부시키기엔 힘들지 않나하는 생각이 듭니다. 물론 단백질에 따라 역할이 알려진 것도 있겠지만 제가 아는한 conserved function은 아직 알려지지 않은 것으로 알고 있습니다. 이런 region을 찾아주는 pattern search에 관련된 문헌은 아래를 참고하시면 좋을 것 같은데요... Methods Enzymol. 1996;266:554-71. Related Articles, Links Analysis of compositionally biased regions in sequence databases 혹시 다른 좋은 정보를 알게되시면 가르쳐 주세요... >안녕하세요. >protein structure or function 에 대한 질문입니다. >제가 연구하고 있는 protein에 serine rich domain이 2개 정도 있는데, pattern search를 하면 항상 나오더군요. >이 부분이 어떤 역할을 하는 지 혹시 아시는지요.