2005-08-31
org.kosen.entty.User@23a29bec
민보경(mbrose)
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Real time PCR을 위한 Probe를 디자인하려고 하는데요.
왕초보라서 아는 것이 없답니다.
1.Probe design 절차
2.Probe design S/W가 있으면 알려주세요.
(S/W가 있다면 사용법도 좀 알려주세요.)
읽어 주셔서 고맙습니다.
- Real time
- PCR
- Probe
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답변 2
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답변
최양애님의 답변
2005-09-12- 0
하고자 하는 실험 유형이 구체적이었으면 답하기가 좀 쉬울 것 같습니다. 저도 실시간 유전자 증폭으로 유전자 발현 연구을 하고 있습니다. 그래서 제가 사용하는 방법을 요약합니다. 1. 발현을 보고자 하는 유전자에 대한 정보를 수집한다.기본적으로 염기 서열, 유전자 구조, 즉 엑손과 인트론 구성 정보, 단백질일 경우 중요 기능적 부위, 등 2. 프라이머를 디자인 할때는 가능하면 엑손과 엑손이 접하는 부위 하나를 프라이머 위치로 선정한다. 3. 프라이머 디자인 프로 그램(: 프라이머 합성을 대행하는 홈페이지에 가면 있고, 생물학 정보 센터(BRIC)에도 있는 것으로 알고 있음)을 이용하여 프라이머 선정. 4. 프라이머 합성 의뢰 5. 원하는 실험 조건에서 프라이머 Test 6. 문제가 없을 시에 실험 실시 도움이 되었으면 합니다. >Real time PCR을 위한 Probe를 디자인하려고 하는데요. >왕초보라서 아는 것이 없답니다. > >1.Probe design 절차 >2.Probe design S/W가 있으면 알려주세요. > (S/W가 있다면 사용법도 좀 알려주세요.) > >읽어 주셔서 고맙습니다. -
답변
DELETED님의 답변
2010-01-09- 0
>Real time PCR을 위한 Probe를 디자인하려고 하는데요.>왕초보라서 아는 것이 없답니다.>>1.Probe design 절차>2.Probe design S/W가 있으면 알려주세요.> (S/W가 있다면 사용법도 좀 알려주세요.)>>읽어 주셔서 고맙습니다. > probe는 왠만한 유전자는 이미 많이 알려져 있고, 특이 유전자인 경우 programe을 이용할 수 있습니다. 업체에 의뢰하시는 것이 가장 빠르지만, 스스로 한다면, 그다지 어렵지 않습니다. 특정 부분을 타겟으로 align하여 가장 중복되지 않은 부분을 선정하시면 됩니다. probe 길이가 있기 때문에 실험시 그다지 error 가 생기지 않으며, probe 를 이용하는 실험 자체가 매우 specific하므로 잘 되리라 봅니다.