2005-10-12
org.kosen.entty.User@6d22ca9b
이승미(ds4nzs)
- 3
안녕하세요.
초보 가우시안 사용자입니다. 정확히 말하면, 예전에 쓰긴 했는데
그때는 gaussview가 있어서 쉽게 submit하느라 고민하지 않았던 문제지요.
다름 아니라, 계산에 필요한 각 원자의 coordinate을 넣을 때
디폴트 옵션이 z-matrix인 것으로 알고 있습니다.
제가 가지고 있는 형태는 xyz, car, pdb 등이고 그런 애들은 사실
들여다 보면 이해가 가는 구조입니다. 그런데 z-matrix는 어떻게
만들어야 될 지 감이 안 옵니다. -.-
혹시 일반적인 형태(car, pdb, xyz 같은)을 z-matrix로 바꾸는
sofrware가 없는지요? 물론 freeware로...
Gaussian 내에서도 그런 역할을 하는 명령어가 있었던 것도 같은데
전혀 기억이 나질 않습니다. =..=
가우시안 고수님들, 도와주세요~~~.
초보사용자 올림
- gaussian
- z-matrix
- sofrware
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 3
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답변
김남두님의 답변
2005-10-13- 0
>안녕하세요. > >초보 가우시안 사용자입니다. 정확히 말하면, 예전에 쓰긴 했는데 >그때는 gaussview가 있어서 쉽게 submit하느라 고민하지 않았던 문제지요. > >다름 아니라, 계산에 필요한 각 원자의 coordinate을 넣을 때 >디폴트 옵션이 z-matrix인 것으로 알고 있습니다. >제가 가지고 있는 형태는 xyz, car, pdb 등이고 그런 애들은 사실 >들여다 보면 이해가 가는 구조입니다. 그런데 z-matrix는 어떻게 >만들어야 될 지 감이 안 옵니다. -.- > >혹시 일반적인 형태(car, pdb, xyz 같은)을 z-matrix로 바꾸는 >sofrware가 없는지요? 물론 freeware로... > >Gaussian 내에서도 그런 역할을 하는 명령어가 있었던 것도 같은데 >전혀 기억이 나질 않습니다. =..= > >가우시안 고수님들, 도와주세요~~~. > > >초보사용자 올림 가우시안에서는 newzmat라는 유틸리티 프로그램을 사용하시면 코드 convert가 가능합니다. 사용방법은 아래의 site를 참조하세요. http://www.gaussian.com/g_ur/u_newzmat.htm 그럼 이만.. -
답변
김남두님의 답변
2005-10-13- 0
>안녕하세요. > >초보 가우시안 사용자입니다. 정확히 말하면, 예전에 쓰긴 했는데 >그때는 gaussview가 있어서 쉽게 submit하느라 고민하지 않았던 문제지요. > >다름 아니라, 계산에 필요한 각 원자의 coordinate을 넣을 때 >디폴트 옵션이 z-matrix인 것으로 알고 있습니다. >제가 가지고 있는 형태는 xyz, car, pdb 등이고 그런 애들은 사실 >들여다 보면 이해가 가는 구조입니다. 그런데 z-matrix는 어떻게 >만들어야 될 지 감이 안 옵니다. -.- > >혹시 일반적인 형태(car, pdb, xyz 같은)을 z-matrix로 바꾸는 >sofrware가 없는지요? 물론 freeware로... > >Gaussian 내에서도 그런 역할을 하는 명령어가 있었던 것도 같은데 >전혀 기억이 나질 않습니다. =..= > >가우시안 고수님들, 도와주세요~~~. > > >초보사용자 올림 일단 가장 쉬운 방법은 Babel(version 1.6)이라는 프로그램을 이용하면, Z-matrix로 쉽게 convert가 가능합니다. 물론 freeware이구요. 보시면, 아마도 쉽세 사용하실 수 있으실겁니다. Babel 프로그램은 google에서 찾으시면 쉽게 받으실 수 있을겁니다. 이 정도면 답변이 되었는지 모르겠습니다. -
답변
이호진님의 답변
2005-10-13- 0
Utilities 밑에 NewZmat를 열면 pdb 파일에서 z-matrix를 만들 수 있습니다 >안녕하세요. > >초보 가우시안 사용자입니다. 정확히 말하면, 예전에 쓰긴 했는데 >그때는 gaussview가 있어서 쉽게 submit하느라 고민하지 않았던 문제지요. > >다름 아니라, 계산에 필요한 각 원자의 coordinate을 넣을 때 >디폴트 옵션이 z-matrix인 것으로 알고 있습니다. >제가 가지고 있는 형태는 xyz, car, pdb 등이고 그런 애들은 사실 >들여다 보면 이해가 가는 구조입니다. 그런데 z-matrix는 어떻게 >만들어야 될 지 감이 안 옵니다. -.- > >혹시 일반적인 형태(car, pdb, xyz 같은)을 z-matrix로 바꾸는 >sofrware가 없는지요? 물론 freeware로... > >Gaussian 내에서도 그런 역할을 하는 명령어가 있었던 것도 같은데 >전혀 기억이 나질 않습니다. =..= > >가우시안 고수님들, 도와주세요~~~. > > >초보사용자 올림