2006-04-21
org.kosen.entty.User@700ab01e
김수원(gene1st)
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외생균의 종을 스크리닝 하는 과정에서
종을 분류하기 위한 기준으로 RFLP패턴 분석을 해보려고 합니다.
외생균 DNA 추출한거를 전부 다 시퀀싱 할 수 없어서
RFLP 패턴 보고, 같은 패턴은 같은 종으로,
다른 패턴은 다른 종으로 생각하고, 분류하려고요....
이 때, RFLP로 잘라진 조각의 크기로도 동정할 수 있는데,
그런데 사진으로는 밴드의 크기를 모르니까...
단편조각의 DNA size 를 몰라서 프로그램을 이용해 보려구 합니다
분석하는 프로그램은 래더로 비교해서 크기 분석해준다고 하는데,
어디서 어떻게 이용해야하는지를 모르겠습니다~
고수님들의 조언 부탁드립니다~~
- RFLP
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 3
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답변
김수원님의 답변
2006-04-22- 0
ㅠ -
답변
김은민님의 답변
2006-04-22- 0
제가 알고 있기로는 BIO-RAD GelDoc 기계내에서 분석 프로그램이 있는걸루 알고있습니다. DNA ladder를 정해주고 내 product의 크기를 계산하는 것이지요.. 이것의 기본 개념은 semi-log paper를 이용하는 것입니다. 정확한 사이즈를 알고싶다면 semi-log paper를 이용하세요.BIO-RAD GelDoc 기계가 있다면 금상첨화겠지만요~ 기계가 발달하고 간소화 되면서 기본 개념은 모른체 일만하게 되는 풍조가 생기는 것같아서 씁쓸합니다. 좋은 답변이 되었는지 모르겠습니다!! -
답변
배우철님의 답변
2006-04-22- 0
terminal restriction fragment length polymorphisms(T-RFLP) 분석 프로그램을 제공하는 Center for Microbial Ecology - Michigan State University의 사이트입니다.. http://rdp8.cme.msu.edu/html/TAP-trflp.html 프로그램을 다운 받아서 인스톨 하시고 사용하시기 바랍니다. > >외생균의 종을 스크리닝 하는 과정에서 >종을 분류하기 위한 기준으로 RFLP패턴 분석을 해보려고 합니다. > >외생균 DNA 추출한거를 전부 다 시퀀싱 할 수 없어서 >RFLP 패턴 보고, 같은 패턴은 같은 종으로, >다른 패턴은 다른 종으로 생각하고, 분류하려고요.... > >이 때, RFLP로 잘라진 조각의 크기로도 동정할 수 있는데, >그런데 사진으로는 밴드의 크기를 모르니까... > >단편조각의 DNA size 를 몰라서 프로그램을 이용해 보려구 합니다 >분석하는 프로그램은 래더로 비교해서 크기 분석해준다고 하는데, >어디서 어떻게 이용해야하는지를 모르겠습니다~ > >고수님들의 조언 부탁드립니다~~ > >