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beads관련 실험 문의

DNA binding protein을 isolation하려고 합니다. 그래서 beads을 이용하려고 하는데요.. 일단 bead에 DNA binding protein과 결합할 DNA가 binding하고 그 다음 그 DNA에 biding하는 DNA binding protein을 붙여서 나중에 DNA binding protein만 isolation하려고 합니다. 근데 이 실험에 적합한 bead을 못 고르겠어요... 도와주세요
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답변 1
  • 답변

    전주홍님의 답변

    가장 쉬운 방법은 biotinylated DNA를 이용하고 streptavidin bead를 이용하는 방법입니다. 일반적으로 primer 주문할 때 옵션으로 biotin을 붙일 수 있습니다. DNA size가 그리 크지 않으면 1) 한쪽 strand에 biotin을 conjugation시킨 걸 주문하고 2) 상보적인 primer(굳이 biotin labeling이 필요업죠)를 주문하여 3) in vitro annealing을 통해 DNA template를 제작할 수 있습니다. 아니면 size를 조금 키워도 되면 promoter 주변을 PCR로 증폭할 때 역시 biotinylated primer를 사용하면 됩니다. >DNA binding protein을 isolation하려고 합니다. >그래서 beads을 이용하려고 하는데요.. >일단 bead에 DNA binding protein과 결합할 DNA가 binding하고 그 다음 그 DNA에 biding하는 DNA binding protein을 붙여서 나중에 DNA binding protein만 isolation하려고 합니다. >근데 이 실험에 적합한 bead을 못 고르겠어요... >도와주세요
    가장 쉬운 방법은 biotinylated DNA를 이용하고 streptavidin bead를 이용하는 방법입니다. 일반적으로 primer 주문할 때 옵션으로 biotin을 붙일 수 있습니다. DNA size가 그리 크지 않으면 1) 한쪽 strand에 biotin을 conjugation시킨 걸 주문하고 2) 상보적인 primer(굳이 biotin labeling이 필요업죠)를 주문하여 3) in vitro annealing을 통해 DNA template를 제작할 수 있습니다. 아니면 size를 조금 키워도 되면 promoter 주변을 PCR로 증폭할 때 역시 biotinylated primer를 사용하면 됩니다. >DNA binding protein을 isolation하려고 합니다. >그래서 beads을 이용하려고 하는데요.. >일단 bead에 DNA binding protein과 결합할 DNA가 binding하고 그 다음 그 DNA에 biding하는 DNA binding protein을 붙여서 나중에 DNA binding protein만 isolation하려고 합니다. >근데 이 실험에 적합한 bead을 못 고르겠어요... >도와주세요
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