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streptavidin bead 실험 관련

streptavidin bead을 이용하여 DNA binding protein을 isolation하려고 하는데요... 먼저 biotin을 가진 oligo을 합성하여 streptavidin bead에 붙인 다음에 cell lysate을 흘려주어서, DNA binding protein을 isolation하려고 합니다. 후에, MALDI_TOF도 하려면 DNA binding protein만 isolation해아 하는데... 어떻게 해야하나요... bead을 띠어내는 거면 어떻게 띠어내는 것인지... 아니면 biotin을 bead에서 띠어내는 거라면.. 띠어낸 후에 DNA binding protein만 후에 어떻게 isolation 할 수 있는지 궁금합니다... 알려주세요,,, 급합니다
  • streptavidin bead
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답변 1
  • 답변

    전주홍님의 답변

    일반적으로 사용하는 SDS-PAGE sample buffer 넣고 5분 이상 끓이면 avidin-biotin 결합이 끊어집니다. 그런 후 SDS-PAGE 하고 단백질 염색을 한 후 band를 오려내면 isolation이 됩니다. 그 다음은 routine한 단백질 질량 분석과정이 되겠지요... 단 control 실험을 반드시 해서 specific band임을 확인하는 것이 중요하겠죠... 그리고 14 kD의 streptavidin fragment가 나올 수 있는데 이것도 control 실험상에서 specificity를 확인할 수 있습니다. 또한 agarose-bead 보다는 magnetic bead가 훨씬 더 깨끗한 결과가 나올 때가 많습니다. >streptavidin bead을 이용하여 DNA binding protein을 isolation하려고 하는데요... >먼저 biotin을 가진 oligo을 합성하여 streptavidin bead에 붙인 다음에 cell lysate을 흘려주어서, DNA binding protein을 isolation하려고 합니다. >후에, MALDI_TOF도 하려면 DNA binding protein만 isolation해아 하는데... >어떻게 해야하나요... >bead을 띠어내는 거면 어떻게 띠어내는 것인지... >아니면 biotin을 bead에서 띠어내는 거라면.. 띠어낸 후에 DNA binding protein만 후에 어떻게 isolation 할 수 있는지 궁금합니다... >알려주세요,,, >급합니다 >
    일반적으로 사용하는 SDS-PAGE sample buffer 넣고 5분 이상 끓이면 avidin-biotin 결합이 끊어집니다. 그런 후 SDS-PAGE 하고 단백질 염색을 한 후 band를 오려내면 isolation이 됩니다. 그 다음은 routine한 단백질 질량 분석과정이 되겠지요... 단 control 실험을 반드시 해서 specific band임을 확인하는 것이 중요하겠죠... 그리고 14 kD의 streptavidin fragment가 나올 수 있는데 이것도 control 실험상에서 specificity를 확인할 수 있습니다. 또한 agarose-bead 보다는 magnetic bead가 훨씬 더 깨끗한 결과가 나올 때가 많습니다. >streptavidin bead을 이용하여 DNA binding protein을 isolation하려고 하는데요... >먼저 biotin을 가진 oligo을 합성하여 streptavidin bead에 붙인 다음에 cell lysate을 흘려주어서, DNA binding protein을 isolation하려고 합니다. >후에, MALDI_TOF도 하려면 DNA binding protein만 isolation해아 하는데... >어떻게 해야하나요... >bead을 띠어내는 거면 어떻게 띠어내는 것인지... >아니면 biotin을 bead에서 띠어내는 거라면.. 띠어낸 후에 DNA binding protein만 후에 어떻게 isolation 할 수 있는지 궁금합니다... >알려주세요,,, >급합니다 >
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