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지식나눔

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DNA Tm value를 실험적으로 구하는 방법은 어떤 것이 있나요?

2006-07-25 org.kosen.entty.User@3111df11 이태화(litaihua)
  • 1
DNA Tm value를 수식으로 예측하고 PCR을 통해서 거의 정확하게 구하는 방법 외에, 혹시 다른 실험적 방법을 알고 계신 분이 계시면 (특히 UV spectroscopy를 이용하여 Tm을 구하는 방법) 도움을 청하겠습니다.
  • DNA
  • Tm value
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답변 1
  • 답변

    정철웅님의 답변

    2006-07-25
    • 0
    >DNA Tm value를 수식으로 예측하고 PCR을 통해서 거의 정확하게 구하는 방법 외에, >혹시 다른 실험적 방법을 알고 계신 분이 계시면 (특히 UV spectroscopy를 이용하여 Tm을 구하는 방법) >도움을 청하겠습니다. DNA는 260nm 파장에서 최고의 흡광도를 보이며, 1 A260 Unit가 ds-DNA는 50ug/ ml,ss-DNA는 33ug/ul, ss-RNA는 40ug/ml, oligomer는 25∼35ug/ml의 농도를 나타냅니다. 즉 50 ug/ml의 ds-DNA 가 ss-DNA로 된다면 1 A260 Unit가 1.515 로 바뀌게 됩니다. 따라서 온도를 점점 올려가면서 흡광도를 측정하면 몇 % 가 ds-->ss로 변했는지 알 수 있으며 Tm 값도 구할수 있을 것입니다.
    답변수정
    >DNA Tm value를 수식으로 예측하고 PCR을 통해서 거의 정확하게 구하는 방법 외에, >혹시 다른 실험적 방법을 알고 계신 분이 계시면 (특히 UV spectroscopy를 이용하여 Tm을 구하는 방법) >도움을 청하겠습니다. DNA는 260nm 파장에서 최고의 흡광도를 보이며, 1 A260 Unit가 ds-DNA는 50ug/ ml,ss-DNA는 33ug/ul, ss-RNA는 40ug/ml, oligomer는 25∼35ug/ml의 농도를 나타냅니다. 즉 50 ug/ml의 ds-DNA 가 ss-DNA로 된다면 1 A260 Unit가 1.515 로 바뀌게 됩니다. 따라서 온도를 점점 올려가면서 흡광도를 측정하면 몇 % 가 ds-->ss로 변했는지 알 수 있으며 Tm 값도 구할수 있을 것입니다.
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