2006-08-03
org.kosen.entty.User@17382418
신장인(blue7576)
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cell에 compound를 처리해서 ROS 증가여부를 분석하고 있는데요..
FACS 사용까지는 잘 알겠거든요.. 근데 분석을...잘 못하겠어요.
histogram으로 그리면.. X축은 FL1-H이고. Y축은 counts로 그래프가 그려지는데... 예전에는 mean 값을 구해서... 그 값으로 막대그래프 그려서 figure로 그렸거든요..
그런데 제가 이번에 실험을 하다보니..
mean값의 의미가 무엇인지 의문이 생기더군요.. 무슨 값에대한 평균인가요?
두번째로는 peak가 shift 되는지로 나타내려고 보니까.. overlay 시키면.. 오른쪽으로 shift 되거든요..
그런데 약물처리하다보면 shift 되기는 하지만.. 그 peak값이... 낮더라는거예요..
shift는 되지만.. peak가 처리 안한 sample peak의 반정도 값이면.. mean 값이 낮아지죠??
이 상황을 어떻게 풀어야할까요...
선수님들의 조언 부탁드립니다...
- ROS
- FACS
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 1
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답변
윤철희님의 답변
2006-08-04- 0
>cell에 compound를 처리해서 ROS 증가여부를 분석하고 있는데요.. >FACS 사용까지는 잘 알겠거든요.. 근데 분석을...잘 못하겠어요. >histogram으로 그리면.. X축은 FL1-H이고. Y축은 counts로 그래프가 그려지는데... 예전에는 mean 값을 구해서... 그 값으로 막대그래프 그려서 figure로 그렸거든요.. >그런데 제가 이번에 실험을 하다보니.. >mean값의 의미가 무엇인지 의문이 생기더군요.. 무슨 값에대한 평균인가요? > > >두번째로는 peak가 shift 되는지로 나타내려고 보니까.. overlay 시키면.. 오른쪽으로 shift 되거든요.. >그런데 약물처리하다보면 shift 되기는 하지만.. 그 peak값이... 낮더라는거예요.. >shift는 되지만.. peak가 처리 안한 sample peak의 반정도 값이면.. mean 값이 낮아지죠?? > >이 상황을 어떻게 풀어야할까요... > >선수님들의 조언 부탁드립니다... > Fl1에 나타나고 있는 것이 말해주는 것은 fluorescence intensity(발광의 강도)로서 형광을 띄는 index 물질 (marker)가 Fl1 channel의 범위에 있다는 것을 말해주고 count는 말 그대로 세포의 갯수가 되겠죠.. mean값은 정해준 population의 mean of fluorescence intensity라고 생각하시면 됩니다. 따라서 peak는 낮을 수 있습니다. 즉 약물에 반응을 보여서 shift 한 세포의 수가 적었던 것이라고 생각하시면 됩니다. 다시말해 peak는 세포의 수, mean값은 세포의 반응정도라고 생각하시면 됩니다. 참고로 mean 값은 일반적으로 말하는 단순평균 값과 GEO mean 값이 있습니다. 좋은 실험 되세요..