2006-09-27
org.kosen.entty.User@663493c6
조성진(sjjosmile)
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codon usage 를 바꾼 염기서열을 받았는데요.
아미노산으로 바꾸면 100% 일치하지만, 바뀐 서열이 난수표를 이용해 코돈 이용 빈도에 따라 기계적으로 바꾼 것이라서, 전사, 번역을 방해 할 만한 2차 구조를 가지는지 확인해 보라는 얘기도 들었습니다.
염기서열 레벨에서 전사, 번역에 관한 2차 구조라는게 무엇을 말하는 건지,
또, genetyx 같은 소프트웨에에서 메뉴얼 분석을 해보라는데 이것도 무슨 말인지
잘 모르겠습니다.
제네틱스에서 해석 방법이나, 염기서열의 2차 구조를 알 수 있는 사이트를 알려주시면
감사하겠습니다.
- DNA
- structure
- analysis
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 1
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답변
김상태님의 답변
2007-01-26- 0
http://www.genebee.msu.su/cgi-bin/nph-rna2.pl 이 사이트에 가셔서 sequence를 넣고 엔터치면 바로 secondary structure를 보실 수 있습니다. 도움이 되었으면 합니다. >codon usage 를 바꾼 염기서열을 받았는데요. >아미노산으로 바꾸면 100% 일치하지만, 바뀐 서열이 난수표를 이용해 코돈 이용 빈도에 따라 기계적으로 바꾼 것이라서, 전사, 번역을 방해 할 만한 2차 구조를 가지는지 확인해 보라는 얘기도 들었습니다. > >염기서열 레벨에서 전사, 번역에 관한 2차 구조라는게 무엇을 말하는 건지, >또, genetyx 같은 소프트웨에에서 메뉴얼 분석을 해보라는데 이것도 무슨 말인지 >잘 모르겠습니다. > >제네틱스에서 해석 방법이나, 염기서열의 2차 구조를 알 수 있는 사이트를 알려주시면 >감사하겠습니다. >