2007-01-05
org.kosen.entty.User@2cc1cd40
박선화(seon@)
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sequence align하는 방법에 대해 알고 싶습니다.
가량, GeneBank에 있는 두가지 gene의 sequecne의 차이를 비교하려고 할때
쉽게 할 수 있는 방법이 있는지 알려주세요^^
- sequence align
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답변 2
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답변
김은민님의 답변
2007-01-05- 0
http://www.ebi.ac.uk/clustalw/로 들어갑니다. 빈공간에 '>' 이 표시를 먼저 치시고, 첫번째 유전자 이름을 치고 enter누른후 sequence를 넣습니다. 두번째 유전자도 '>'를 치시고 이름 치고 enter누른후 sequence를 넣습니다. 그리고 “Run“을 누르면 분석을 해준답니다. 김성환 선생님께서 알려주신 방법이 주로 사용하는 방법이구요~ 그 방법으로 부족하시다면 이 방법도 사용해보세요~ ^^ 좋은 답변이 되었는지 모르겠습니다!! ^^ -
답변
김성환님의 답변
2007-01-05- 0
1. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/에 접속 2. 상단 중앙에 있는 BLAST에 들어간다 3. 하단 special에 있는 'Align two sequences (bl2seq)에 들어간다. 4. 'Sequence 1'과 '2'에 비교하고자 하는 sequence를 넣는다. 이때 유전자의 accession no.를 넣어도 된다. 5. 왼쪽 하단에 있는 'Align'을 누른다 ,. 6. 결과가 나온다. 얼마나 어디에 어떻게 유사성이 있는지 볼수 있다.