2007-03-15
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홍경옥(hongko95)
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대부분의 회사가 어떤chip을 쓰느냐에 따라 microarray가격이 달라지는것 같은데 어떤것을 쓰면 좋을까요?
- microarray
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답변 2
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최영욱님의 답변
2007-03-15- 0
>대부분의 회사가 어떤chip을 쓰느냐에 따라 microarray가격이 달라지는것 같은데 어떤것을 쓰면 좋을까요? > 어떤 목적의 실험의 생각하시는지에 따라서 다릅니다. 1. SNP 분석이라면 일명 Bead array라고 하는 illumina라는 회사의 chip이 독보적이라고 합니다. 2. Expression array는 글쎄요... 이것도 어떤 목적이냐에 따라 달라지는데요 whole genome을 보고자 하신다면 affiy metrix라는 회사가 가장 좋다고 알려져 있습니다. 또한 one-dye system, two-dye system으로 나눌수 있는데요 one-dye는 sample 하나당 하나의 칩을 사용하여서 절대적인 발현량을 알수 있고, two-dye system이 control vs sample간의 상대적인 발현량을 알수 있습니다. 3. customzied chip이 있을 수 있는데요 목적에 맞는 gene만을 이용하여 chip을 제작하여 하는 방법이 있습니다. 제가 글솜씨가 좀 없어서 ^^;; 도움이 되셨나 모르겠네요... -
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박수제님의 답변
2007-03-16- 0
>대부분의 회사가 어떤chip을 쓰느냐에 따라 microarray가격이 달라지는것 같은데 어떤것을 쓰면 좋을까요? > 저는 누리셀을 쓰고 있는데요.. 먼저 어떤 것을 target으로 할 것인지를 정하는 것도 중요하구요.. Chip slide에 amine기가 coating 되어 있는 것으로 쓸 것인지.. 이래저래 복잡하지만.. 국내 제품도 괜찮을 것 같습니다. 경신과학쪽에 문의해보시지요? 강성원 차장님이라고 계신데... 이쪽에서 상당한 양의 Chip 정보를 가지고 있는 것 같습니다. 참고로 전 이분과 친분관계가 있는 것은 아니지만.. chip setup시 도움이 될 것 같습니다.