지식나눔

Inclusion body protein을 solubilization 하는 방법이 궁금합니다.

제가 지금 protein 정제 작업을 하는데 inclusion body(IB) protein으로 나오는 것을 solubilization하여 동물에게 먹임으로써 치료 효과가 있는지 확인하는 실험을 하고 있습니다. 그런데 IB protein을 solubilization하는 방법으로 보통 8M Urea Tris-HCl pH8.0 buffer를 이용하여 실험하였습니다. 이번에 정제하고자 하는 protein은 그 조건에서 녹지 않아 9M Urea, 6M Guanidine HCl, 1% SDS 이런 조건으로 녹였습니다. 1% SDS에서 가장 잘 녹았고 6M Guanidine HCl도 잘녹았습니다. 문제는 1% SDS로 녹였을시 SDS를 제거하기가 쉽지 않을 뿐 더러 SDS가 얼마나 있는지 확인도 어렵다는 것입니다. 6M Guanidine HCl로 녹인 것을 serial dialysis(6M->3M->1.5M->0MX3)로 Guanidine을 제거하였더니 많은 양의 침전이 생겼습니다. 보통 Urea serial dialysis 하였을때는 그런 침전이 거의 안생겼는데 Guanidine은 왜 생기는지도 궁금합니다. 마지막으로 SDS로 IB를 녹인후 그것을 정제하여 in vivo 실험을 한 paper가 있는지도 궁금합니다. 제가 찾아보려구 했는데 저는 찾지 못했어요^^;
  • inclusion body
  • solubilization
지식의 출발은 질문, 모든 지식의 완성은 답변! 
각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
답변 1
  • 답변

    배덕환님의 답변

    >제가 지금 protein 정제 작업을 하는데 inclusion body(IB) protein으로 나오는 것을 solubilization하여 동물에게 먹임으로써 치료 효과가 있는지 확인하는 실험을 하고 있습니다. 그런데 IB protein을 solubilization하는 방법으로 보통 8M Urea Tris-HCl pH8.0 buffer를 이용하여 실험하였습니다. 이번에 정제하고자 하는 protein은 그 조건에서 녹지 않아 9M Urea, 6M Guanidine HCl, 1% SDS 이런 조건으로 녹였습니다. 1% SDS에서 가장 잘 녹았고 6M Guanidine HCl도 잘녹았습니다. 문제는 1% SDS로 녹였을시 SDS를 제거하기가 쉽지 않을 뿐 더러 SDS가 얼마나 있는지 확인도 어렵다는 것입니다. >6M Guanidine HCl로 녹인 것을 serial dialysis(6M->3M->1.5M->0MX3)로 Guanidine을 제거하였더니 많은 양의 침전이 생겼습니다. 보통 Urea serial dialysis 하였을때는 그런 침전이 거의 안생겼는데 Guanidine은 왜 생기는지도 궁금합니다. >마지막으로 SDS로 IB를 녹인후 그것을 정제하여 in vivo 실험을 한 paper가 있는지도 궁금합니다. 제가 찾아보려구 했는데 저는 찾지 못했어요^^; > solubilization의 정의는 물에 녹기 어려운 물질이나 녹지 않는 물질을 투명하게 용해시키는 방법으로서 계면활성제(가용화제라고도 함, SDS 포함)를 이용합니다. 제 생각으로는 식용 계면활성제 Tween 60, 80 또는 의약용 그레이드나 화장품용 그레이드인 POE60 또는 PEG40 Hydrogenated caster oil의 가용화제를 사용해 보세요
    >제가 지금 protein 정제 작업을 하는데 inclusion body(IB) protein으로 나오는 것을 solubilization하여 동물에게 먹임으로써 치료 효과가 있는지 확인하는 실험을 하고 있습니다. 그런데 IB protein을 solubilization하는 방법으로 보통 8M Urea Tris-HCl pH8.0 buffer를 이용하여 실험하였습니다. 이번에 정제하고자 하는 protein은 그 조건에서 녹지 않아 9M Urea, 6M Guanidine HCl, 1% SDS 이런 조건으로 녹였습니다. 1% SDS에서 가장 잘 녹았고 6M Guanidine HCl도 잘녹았습니다. 문제는 1% SDS로 녹였을시 SDS를 제거하기가 쉽지 않을 뿐 더러 SDS가 얼마나 있는지 확인도 어렵다는 것입니다. >6M Guanidine HCl로 녹인 것을 serial dialysis(6M->3M->1.5M->0MX3)로 Guanidine을 제거하였더니 많은 양의 침전이 생겼습니다. 보통 Urea serial dialysis 하였을때는 그런 침전이 거의 안생겼는데 Guanidine은 왜 생기는지도 궁금합니다. >마지막으로 SDS로 IB를 녹인후 그것을 정제하여 in vivo 실험을 한 paper가 있는지도 궁금합니다. 제가 찾아보려구 했는데 저는 찾지 못했어요^^; > solubilization의 정의는 물에 녹기 어려운 물질이나 녹지 않는 물질을 투명하게 용해시키는 방법으로서 계면활성제(가용화제라고도 함, SDS 포함)를 이용합니다. 제 생각으로는 식용 계면활성제 Tween 60, 80 또는 의약용 그레이드나 화장품용 그레이드인 POE60 또는 PEG40 Hydrogenated caster oil의 가용화제를 사용해 보세요
    등록된 댓글이 없습니다.