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지식나눔

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transcription factor와 target gene binding을 알고 싶어요

2007-10-02 org.kosen.entty.User@13ad221 구경화(whakyung)
  • 1
제가 보고자 하는 것은 AP-1(c-Jun과 c-fos complex)가 GATA6 gene과 binding하는지 알아 보고 싶습니다. 또 다른 target gene과 결합해서 expression시키는지 알아 보고 싶습니다. 우선 실험적인 것을 들어가기에 앞서서 이론적으로 binding의 가능성을 보고 싶은데요 NCBI에 들어가면 혹시 알 수 있지 않을까요? 알고 계신다면 꼭 대답해 주셨으면 합니다.
  • transcription factor
  • gene binding site
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답변 1
  • 답변

    장성재님의 답변

    2007-10-02
    • 1

    첨부파일

    이론적으로 전사 인자와 유전자 간의 결합을 알아보고 싶다고 하셨는데, 일반적인 사이트를 소개해드리도록 하겠습니다. http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html http://www.bioinfo.tsinghua.edu.cn/~zhengjsh/OTFBS/ 이것으로 확인이 가능하셨다면 실질적으로 결합하는지를 assay계에서 측정하셔야겠지요. 요즘은 assay kit가 개발이 잘되어 있어서 키트를 구매하여 사용하시면 됩니다. 원하시는 AP-1과의 결합을 측정하는 전문 키트도 시판하고 있더군요. 첨부 화일들을 참고하세요. 그리고 벡터 등에 삽입 후 화학 발광법 등을 이용해 정량 가능한 reporter assay system 등도 있으니 참고 바랍니다. 첨부 화일을 참고하세요.
    답변수정
    이론적으로 전사 인자와 유전자 간의 결합을 알아보고 싶다고 하셨는데, 일반적인 사이트를 소개해드리도록 하겠습니다. http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html http://www.bioinfo.tsinghua.edu.cn/~zhengjsh/OTFBS/ 이것으로 확인이 가능하셨다면 실질적으로 결합하는지를 assay계에서 측정하셔야겠지요. 요즘은 assay kit가 개발이 잘되어 있어서 키트를 구매하여 사용하시면 됩니다. 원하시는 AP-1과의 결합을 측정하는 전문 키트도 시판하고 있더군요. 첨부 화일들을 참고하세요. 그리고 벡터 등에 삽입 후 화학 발광법 등을 이용해 정량 가능한 reporter assay system 등도 있으니 참고 바랍니다. 첨부 화일을 참고하세요.
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