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Protease cleavage site 예측

제가 관심있는 유전자가 50 kDa 정도 인데요 C term쪽에서 33kDa과 17 kDa으로 cleavage가 일어나는 것 같습니다. 그런데 어떤 protease에 의해서 잘리고 site는 어디일지를 예측하고 싶은데 그런 site가 있는지요? 제가 ExPASY에서 PeptideCutter에 제 유전자를 넣었더니 비슷한 위치에서 잘리는 enzyme이 상당히 많이 나오더라고요. 더 specific하게 알 수 있는 방법은 없을까요??
  • Protease
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답변 2
  • 답변

    박성철님의 답변

    >제가 관심있는 유전자가 50 kDa 정도 인데요 >C term쪽에서 33kDa과 17 kDa으로 cleavage가 일어나는 것 >같습니다. >그런데 어떤 protease에 의해서 잘리고 site는 어디일지를 >예측하고 싶은데 그런 site가 있는지요? >제가 ExPASY에서 PeptideCutter에 제 유전자를 넣었더니 >비슷한 위치에서 잘리는 enzyme이 상당히 많이 나오더라고요. >더 specific하게 알 수 있는 방법은 없을까요?? generunner라는 programe 이나 ExPASy에 들어가면 알수 있을것 같은데요...
    >제가 관심있는 유전자가 50 kDa 정도 인데요 >C term쪽에서 33kDa과 17 kDa으로 cleavage가 일어나는 것 >같습니다. >그런데 어떤 protease에 의해서 잘리고 site는 어디일지를 >예측하고 싶은데 그런 site가 있는지요? >제가 ExPASY에서 PeptideCutter에 제 유전자를 넣었더니 >비슷한 위치에서 잘리는 enzyme이 상당히 많이 나오더라고요. >더 specific하게 알 수 있는 방법은 없을까요?? generunner라는 programe 이나 ExPASy에 들어가면 알수 있을것 같은데요...
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  • 답변

    안길홍님의 답변

    유전자에 대하여서는 전혀 모르나,앞의 schpart9님께서 generunner또는 expasy -software로 가능하다고 하여서 freeware인 software를 검색하여보니 많은 freeware를 찾을 수 있었습니다. 찾기에 비교적 쉽군요. 다음 요령에 의하여 software를 download받아 실험에 적용하여 보시기를 바랍니다. google.com에 접속하십시요. 그리고 첫번째로 검색어 “generunner,software,freeware“로써 searching 하시면 둘째칸에 나오는 제목을 click하시면 첨부file과 같은 내용이 나오며,software를 download받을 수 있습니다. 다음으로 generunner대신 expasy단어로 바꾸어서 검색하면 또한 download 받을 수 있는 회사가 나옵니다(유첨 file과 같음) 2가지 모두 freeware로써 실험연구용으로 사용가능하도록 되어 있군요. 도움이 되시기를....
    유전자에 대하여서는 전혀 모르나,앞의 schpart9님께서 generunner또는 expasy -software로 가능하다고 하여서 freeware인 software를 검색하여보니 많은 freeware를 찾을 수 있었습니다. 찾기에 비교적 쉽군요. 다음 요령에 의하여 software를 download받아 실험에 적용하여 보시기를 바랍니다. google.com에 접속하십시요. 그리고 첫번째로 검색어 “generunner,software,freeware“로써 searching 하시면 둘째칸에 나오는 제목을 click하시면 첨부file과 같은 내용이 나오며,software를 download받을 수 있습니다. 다음으로 generunner대신 expasy단어로 바꾸어서 검색하면 또한 download 받을 수 있는 회사가 나옵니다(유첨 file과 같음) 2가지 모두 freeware로써 실험연구용으로 사용가능하도록 되어 있군요. 도움이 되시기를....
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