지식나눔

proteomics 방법 중에 질문입니다.

실험내용중에 SELDI-TOF-MS 가 있는데 약자도 안나와있고 말디토프는 알겠는데 이건 잘모르겠어서요 그리고 ICAT Isotope-coded affinity tags 는 어떤 방법인가요? 면접이 내일 모레인데... 이러구 있습니다. 부탁드립니다.
  • proteomics
  • ICAT
  • ITRAQ
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답변 1
  • 답변

    장성재님의 답변

    # SELDI-TOF-MS Surfaced Enhanced Laser Desorption/Ionization - Time of Flight - Mass Spectrometry를 일컫는 것으로, 특수한 chromatographic 표면 처리를 한 protein chip array 위에서 직접 crude extract 혹은 sample mixture의 단백질을 capturing 및 정제 과정을 거친 후, 표적 단백질을 laser에 의한 desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry에 의해 검출하는 technique 입니다. 즉, SELDI는 시료의 이온화 과정과 관련된 장치명입니다. MALDI의 경우와 구분이 되실 줄 압니다. # ICAT (Isotope-coded affinity tags) 단백질의 정량화 방법 중에는 라벨링 (Labeling)을 통해 표준 물질과 분석 시료의 크기를 비교하는 상대 정량 분석이 흔히 사용됩니다. 이때에 시료의 특정 아미노산을 라벨링하는 방법 중 시스테인을 변형시키는 방법이 ICAT입니다. 리신을 변형시키는 방법으로 최근에는 iTRAQTM이라는 것이 상용화되어 있다고 합니다. 질량 분석을 통한 Proteomics에 관한 한글로 된 자료를 한부 첨부합니다. 참고하시길.... 면접 잘 보시길...^^
    # SELDI-TOF-MS Surfaced Enhanced Laser Desorption/Ionization - Time of Flight - Mass Spectrometry를 일컫는 것으로, 특수한 chromatographic 표면 처리를 한 protein chip array 위에서 직접 crude extract 혹은 sample mixture의 단백질을 capturing 및 정제 과정을 거친 후, 표적 단백질을 laser에 의한 desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry에 의해 검출하는 technique 입니다. 즉, SELDI는 시료의 이온화 과정과 관련된 장치명입니다. MALDI의 경우와 구분이 되실 줄 압니다. # ICAT (Isotope-coded affinity tags) 단백질의 정량화 방법 중에는 라벨링 (Labeling)을 통해 표준 물질과 분석 시료의 크기를 비교하는 상대 정량 분석이 흔히 사용됩니다. 이때에 시료의 특정 아미노산을 라벨링하는 방법 중 시스테인을 변형시키는 방법이 ICAT입니다. 리신을 변형시키는 방법으로 최근에는 iTRAQTM이라는 것이 상용화되어 있다고 합니다. 질량 분석을 통한 Proteomics에 관한 한글로 된 자료를 한부 첨부합니다. 참고하시길.... 면접 잘 보시길...^^
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