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sorption실험을 해야하는 합니다. 어떤 형태의 sorption을 보이냐에따라 Ki인지 Kd인지 그때 결정할 수 있습니다. chemical engineering이나 soil science책에 있습니다.

>receptr bindig affinity assay(agonist/antagonist)에서 얘기하는 >Ki value, Kd value가 정확히 어떤 값을 얘기하나요? Ki : inhibition constant입니다. Kd : dissociation constant입니다. >그리고 이들 값을 정확히 어떻게 구하나요? >통계progrm을 이용해 실험 데이타 수치를 넣어 계산하나요? >특히, Kd value값 구하는 방법을 자세히 알고 싶어요... 실험적으로 구합니다. 간단히 설명하면, A라는 물질에 B라는 라이갠드(또는 인히비터)를 붙여보면서, 어느정도의 농도비에서 반응이 일어나는가를 추적합니다. Kd는, 말 그대로 A와 B의 결합형태에서 B가 떨어저 나오는 비율이라고 보시면 됩니다. (반대로, A에 B가 붙는 비율은 결합 상수Ka, association constant입니다.) 수식으로 쓰면 다음과 같습니다. A + B <-> AB 일 때, (복잡하니 그냥 1차식으로 합니다.) Kd = [A][B]/[AB] 입니다. (꺽쇠로 묶은 건 그 물질의 농도를 말합니다.) 실험적으로는, 결합 상태와 결합하지 않은 상태를 측정할 수 있는 방법을 통해 각 상태의 농도를 구한 다음 저 식에 집어넣으면 됩니다. Ki는 반응 수식이 좀 복잡해지는데, 기본적으로 특정한 Kd값이 알려져 있는 상황에서 새로운 물질 C를 집어넣어서 이놈이 어느정도나 그 결합을 저해하는가를 말하는 것이 보통입니다. (그냥 Kd를 말할 때도 있습니다만, 보통은 기본 반응식이 있다는 전제 하에 그걸 저해하는 경우에 적용합니다.) 따라서 식이 복잡해집니다. A+B <-> AB A+C <-> AC AB + C <-> AC + B AB + C <-> ABC .... 등으로 상당히 많은 가능성이 나오고, 이중 어느 반응들이 일어나는가를 확인해서 식을 풀어야 합니다. 복잡하니 보통 A와 B의 농도는 특정 조건으로 고정됩니다. 생화학 또는 물리화학 교과서를 조금 자세히 읽어보시면 보다 나은 설명들이 있습니다. 참고하세요.

>receptr bindig affinity assay(agonist/antagonist)에서 얘기하는 >Ki value, Kd value가 정확히 어떤 값을 얘기하나요? > >그리고 이들 값을 정확히 어떻게 구하나요? >통계progrm을 이용해 실험 데이타 수치를 넣어 계산하나요? >특히, Kd value값 구하는 방법을 자세히 알고 싶어요... 분배계수를 구하는데 흡착실험에서 주로 사용하면 저희는 UO2흡착이나 I흡착에서 Kd값을 축정해서 안정성 쪽으로 주는데 실험이 잘되지는 않는편같아요. Octanol-Water Partition Coefficient Estimation by JAVA applet Draw molecule at cyan panel. How to use animation1, animation2 Change atom type or delete atom, mouse down and up at the same atom. Cis-, Trans- compounds return average of both. Hydrogen will be added automatically by program. The octanol/water partition coefficient (Kow)1 is defined as the ratio of a chemical's concentration in the octanol phase to its concentration in the aqueous phase of a two-phase octanol/water system. Kow = Concentration in octanol phase / Concentration in aqueous phase ( I -1 ) Values of Kow are thus unitless. The parameter is measured using low solute concentrations, where Kow is a very weak function of solute concentration. Values of Kow are usually measured at room temperature (20 or 25'C . The effect of temperature on Kow is not great - usually on the order of 0.001 to 0.01 Iog Kow units per degree - and may be either positive or negative. Measured values of Kow for organic chemicals have been found as low as 10-3 and as high as 107, thus encompassing a range of ten orders of magnitude. In terms of log Kow, this range is from -3 to 7. It is frequently possible to estimate log Kow with an uncertainty (i.e., method error) of no more than 10.1-0.2 Iog Kow units. The octanol/water partition coefficient is not the same as the ratio of a chemical's solubility in octanol to its solubility in water, because the organic and aqueous phases of the binary octanol/water system are not pure octanol and pure water. At equilibrium, the organic phase contains 2.3 mol/L of water, and the aqueous phase contains 4.5 X 10-8 mol/L of octanol. Moreover, Kow is often found to be a function of solute concentration. The chemical in question is added to a mixture of octanol and water whose volume ratio is adjusted according to the expected value of Kow. 1. Very pure octanol and water must be used, and the concentration of the solute in the system should be less than 0.01 mol/L. (순수한 옥탄올과 물이 사용되어야 한다.) 2. The system is shaken gently until equilibrium is achieved (15 min to I hr). Centrifugation is generally required to separate the two phases, especially if an emulsion has formed. (물과 옥탄올을 완전히 분리해야 한다. emulsion이 생겼을 때는 보통 원심분리를 해야한다.) 3. An appropriate analytical technique is then used to determine the solute concentration in each phase. (각각의 농도를 측정한다.) A rapid laboratory estimate of Kow may be obtained by measuring the retention time in a high-pressure liquid chromatography system; the logarithm of the retention time and the logarithm of Kow have been found to be linearly related. In recent years the octanol/water partition coefficient has become a key parameter in studies of the environmental fate of organic chemicals. It has been found to be related to water solubility, soil/sediment adsorption coefficients, and bioconcentration factors for aquatic life. Because of its increasing use in the estimation of these other properties, Kow is considered a required property in studies of new or problematic chemicals. Values of Kow can be considered to have some meaning in themselves, since they represent the tendency of the chemical to partition itself between an organic phase (e.g., a fish, a soil) and an aqueous phase. Chemicals with low Kow values (e.g., less than 10) may be considered relatively hydrophilic; they tend to have high water solubilities, small soil/sediment adsorption coefficients, and small bioconcentration factors for aquatic life. Conversely, chemicals with high Kow values (e.g., greater than 104) are very hydrophobic. http://www.pirika.com/chem/TCPEE/LOGKOW/ourlogKow.htm 여기한번참고하세요.