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cellulase activity측정 방법 질문 (filter paper assay)

Cellulase의 활성을 측정하고 싶어 filter paper assay에 관한 논문을 읽고 실험을 수행하려 하고 있습니다. 그런데 논문에서 제시한 프로토콜에서 이해가 안돼는 부분이 많습니다. 프로토콜을 살펴보면 첫번째로 Add 0.05M Na-citrate, pH 4.8, to a test tube of volume at least 25ml. 이란 문구가 보이는 데요... 말 그대로 pH 4.8의 Na-citrate sol.을 1ml 주입하라는 건가요? 그런데 실제로 0.05M의 Na-citrate sol.의 pH를 측정해보니 8.3정도가 나오는데 제가 먼가 잘못한건가요?... Unit calculation에 대해서도 FPU = {0.37/(enzyme concentration to release 2.0mg glucose)} units/ml 이라고 정의해 놨는데.... 실험에 따라 2.0mg의 glucose가 생성된 enzyme concentration을 얻었다면 여기에 넣어 계산한 값(우항값)이 활성도인가요?? FPU의 단위를 쓰려면 다시 계산을 해줘야 할 거 같은데...이 식이 잘 이해가 안갑니다. 에휴...두서없이 써서 어째 질문 사항이 잘 전달이 안될지도 모르겠네요... 초짜라서 이래저래 고생하고 있습니다. 도와주시면 감사하겠습니다.^^
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    박윤희님의 답변

    첫번째 질문에 대한 답은 프로토콜의 일부만 발췌하여 정확하게는 모르겠네요. 두번재 질문은 Na-citrate를 녹인 뒤에 citric acid로 pH를 맞춰줘야할것 같은데요. 한문장만 가지고 뭐라 말씀 드리기가 뭣하네염.... 별 도움이 못된것 같아 죄송,...
    첫번째 질문에 대한 답은 프로토콜의 일부만 발췌하여 정확하게는 모르겠네요. 두번재 질문은 Na-citrate를 녹인 뒤에 citric acid로 pH를 맞춰줘야할것 같은데요. 한문장만 가지고 뭐라 말씀 드리기가 뭣하네염.... 별 도움이 못된것 같아 죄송,...
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    장성재님의 답변

    >Cellulase의 활성을 측정하고 싶어 filter paper assay에 관한 논문을 읽고 실험을 수행하려 하고 있습니다. 그런데 논문에서 제시한 프로토콜에서 이해가 안돼는 부분이 많습니다. >프로토콜을 살펴보면 첫번째로 Add 0.05M Na-citrate, pH 4.8, to a test tube of volume at least 25ml. 이란 문구가 보이는 데요... >말 그대로 pH 4.8의 Na-citrate sol.을 1ml 주입하라는 건가요? >그런데 실제로 0.05M의 Na-citrate sol.의 pH를 측정해보니 8.3정도가 나오는데 제가 먼가 잘못한건가요?... Sodium citrate solution을 직접 사용하시는 것이 아니라 citric acid와 Na-citrate를 이용하여 buffer를 만드신 후 그 버퍼를 사용하라는 것 입니다. 논문에는 citrate buffer라고 써있을 겁니다. pH 4.8의 0.05M citrate buffer를 1mL 사용하라는 말입니다. Citric acid가 약산이며, Na-citrate는 약 염기성 입니다. 따라서 buffer가 되는 것 이지요. >Unit calculation에 대해서도 >FPU = {0.37/(enzyme concentration to release 2.0mg glucose)} units/ml >이라고 정의해 놨는데.... >실험에 따라 2.0mg의 glucose가 생성된 enzyme concentration을 얻었다면 여기에 넣어 계산한 값(우항값)이 활성도인가요?? FPU의 단위를 쓰려면 다시 계산을 해줘야 할 거 같은데...이 식이 잘 이해가 안갑니다. >에휴...두서없이 써서 어째 질문 사항이 잘 전달이 안될지도 모르겠네요... >초짜라서 이래저래 고생하고 있습니다. 도와주시면 감사하겠습니다.^^ cellulase 활성을 측정하는 것과 일반적인 전분 분해 효소의 활성을 측정하는 것은 같은 개념입니다. 단지 기질을 cellulose (paper disc)를 사용하는 것 뿐 이지요. 환원당의 발색법을 이용한 DNS assay가 기본입니다. cellulose가 분해되면서 발생하는 환원당의 농도를 측정하여 역으로 분해력으로 표시하는 것이지요. 도움이 되셨는지?
    >Cellulase의 활성을 측정하고 싶어 filter paper assay에 관한 논문을 읽고 실험을 수행하려 하고 있습니다. 그런데 논문에서 제시한 프로토콜에서 이해가 안돼는 부분이 많습니다. >프로토콜을 살펴보면 첫번째로 Add 0.05M Na-citrate, pH 4.8, to a test tube of volume at least 25ml. 이란 문구가 보이는 데요... >말 그대로 pH 4.8의 Na-citrate sol.을 1ml 주입하라는 건가요? >그런데 실제로 0.05M의 Na-citrate sol.의 pH를 측정해보니 8.3정도가 나오는데 제가 먼가 잘못한건가요?... Sodium citrate solution을 직접 사용하시는 것이 아니라 citric acid와 Na-citrate를 이용하여 buffer를 만드신 후 그 버퍼를 사용하라는 것 입니다. 논문에는 citrate buffer라고 써있을 겁니다. pH 4.8의 0.05M citrate buffer를 1mL 사용하라는 말입니다. Citric acid가 약산이며, Na-citrate는 약 염기성 입니다. 따라서 buffer가 되는 것 이지요. >Unit calculation에 대해서도 >FPU = {0.37/(enzyme concentration to release 2.0mg glucose)} units/ml >이라고 정의해 놨는데.... >실험에 따라 2.0mg의 glucose가 생성된 enzyme concentration을 얻었다면 여기에 넣어 계산한 값(우항값)이 활성도인가요?? FPU의 단위를 쓰려면 다시 계산을 해줘야 할 거 같은데...이 식이 잘 이해가 안갑니다. >에휴...두서없이 써서 어째 질문 사항이 잘 전달이 안될지도 모르겠네요... >초짜라서 이래저래 고생하고 있습니다. 도와주시면 감사하겠습니다.^^ cellulase 활성을 측정하는 것과 일반적인 전분 분해 효소의 활성을 측정하는 것은 같은 개념입니다. 단지 기질을 cellulose (paper disc)를 사용하는 것 뿐 이지요. 환원당의 발색법을 이용한 DNS assay가 기본입니다. cellulose가 분해되면서 발생하는 환원당의 농도를 측정하여 역으로 분해력으로 표시하는 것이지요. 도움이 되셨는지?
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