2007-12-20
org.kosen.entty.User@63f55b3c
전찬혁(donjun)
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안녕하십니까?
바이러스학을 배우고 있는 학도 입니다.
계통수에 대한 논문을 보았는데, 어떤것은 unrooted tree이고 어떤것은
rooted tree더라고요.
어떤 특징이 있는지 궁금합니다.
Bootstrap values for 1000 replicates 란말이 있는데
이 말이 1000번 복제했을때 몇번의 미스 매치가 나온다는 소리같은데,
이런것등의 기본적인 개념도 잘 와닿지가 않고요..
고수님들의 답변 부탁 드립니다...
- Phylogenetic tree
- unrooted
- rooted
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 2
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답변
이상후님의 답변
2008-01-04- 0
우선 root는 common ancestor를 나타내는데, rooted tree는 root로 부터 각 node까지의 path가 evolutionary path를 나타내며, unrooted tree는 evolutionary path를 나타내는 것이 아니라 사물들(예로, genes, strains, species 등)사이의 관계를 나타내는 것이 특징입니다. 그리고 bootstrap values는 이해하기 다소 어려운 용어인데,어떤 특별한 가지 패턴의 통계적인 중요성을 측정하기 위해서 통계적인 테스트가 수행되어야 하는데 그 중에 하나가 resampling법입니다. 이 resampling법중에 하나가 bootstrap법인데,data를 반복적으로 resampling하거나 계통도 제작 방법으로 만들어진 측정치의 다양성을 실험적으로 추론하는 방법입니다.Bootstrap 값은 이상적으로 95%보다 높거나 같아야만 한다는 것이 특징입니다.만약에 특정한 가지치기 유형이 80%로 관찰된다면 이 가지치기 유형은 80%의 bootstrap support를 받는다고 말할 수 있습니다. 참고적으로 rooted tree와 unrooted tree 그림을 참고하세요. -
답변
안길홍님의 답변
2010-01-25- 0
>안녕하십니까?>바이러스학을 배우고 있는 학도 입니다.>계통수에 대한 논문을 보았는데, 어떤것은 unrooted tree이고 어떤것은>rooted tree더라고요.>어떤 특징이 있는지 궁금합니다.>>Bootstrap values for 1000 replicates 란말이 있는데>이 말이 1000번 복제했을때 몇번의 미스 매치가 나온다는 소리같은데,>이런것등의 기본적인 개념도 잘 와닿지가 않고요..>>고수님들의 답변 부탁 드립니다... 첨부 자료