지식나눔

RT-PCR primer와 real time PCR primer의 구분

real time PCR primer에 사용하던 primer를 일반적으로 하는 RT-PCR(유전자 발현 확인 및 상대적인 발현의 양 확인 하고자 할때)primer로 사용해도 될까요? 만약 안되면 어떤 이유인가요? 선배님들 가르쳐 주세요~~!! 가르쳐 주세요.
  • real time PCR primer
  • RT-PCR
  • primer
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답변 1
  • 답변

    김정모님의 답변

    이론상으론 아마 될수도 있겠지만 real-time PCR (rt PCR)의 경우 50~150bp 사이의 amplicon이 되게 제작을 하기 때문에.. RT PCR로 사용을 하였을 때 젤 상에서 봤을 때, dimer등의 찌꺼기와 명확하게 구분이 잘 안되는 문제가 있습니다. 150bp 정도는 구분이 될수도 있겠지만 작은 size일 수록 젤 상에서 구분이 힘든이유에서 입니다.
    이론상으론 아마 될수도 있겠지만 real-time PCR (rt PCR)의 경우 50~150bp 사이의 amplicon이 되게 제작을 하기 때문에.. RT PCR로 사용을 하였을 때 젤 상에서 봤을 때, dimer등의 찌꺼기와 명확하게 구분이 잘 안되는 문제가 있습니다. 150bp 정도는 구분이 될수도 있겠지만 작은 size일 수록 젤 상에서 구분이 힘든이유에서 입니다.
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