지식나눔

whole genome으로 microarray hybridization

genomic DNA를 whole genome amplication kit를 사용해서 증폭하여 유리 슬라이드에 probe를 심고 hybridization을 하여 SNP 분석을 하려고 합니다. 근데 hyb.조건이 맞질 않는지 분리능이 보이질 않네요. 혹 hyb.조건이나 노하우가 있으신분의 도움 부탁드립니다.
  • whole genome
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답변 1
  • 답변

    박수제님의 답변

    >genomic DNA를 whole genome amplication kit를 사용해서 증폭하여 유리 슬라이드에 probe를 심고 hybridization을 하여 SNP 분석을 하려고 합니다. >근데 hyb.조건이 맞질 않는지 분리능이 보이질 않네요. >혹 hyb.조건이나 노하우가 있으신분의 도움 부탁드립니다. 지나가다가 들려서 답변해드립니다. ^^;; 우선 whole genome을 amplication하셨다면 충분히 denature 시켜줘야 합니다... 보통 끓이죠.. 그리고 온도의 변화가 없이 바로 slide에 놓고.. chamber로 넣어두는데... 모든 시약을 다 넣은 상태에서 chamber를 끓이거나, hybridization temp을 40, 50, 60 도 이런식으로 해보시는 것이 좋을 것 같습니다. 그리고 whole genome이 양이 많다면.. 좀.. 그렇겠죠... 아무래도 점성이 많을 것이니깐... whole genome 혹은 metagenome을 array에 실어서 실험한 결과가 최근에 publish 되었습니다~ 찾아보심이 좋을 것 같네요~~
    >genomic DNA를 whole genome amplication kit를 사용해서 증폭하여 유리 슬라이드에 probe를 심고 hybridization을 하여 SNP 분석을 하려고 합니다. >근데 hyb.조건이 맞질 않는지 분리능이 보이질 않네요. >혹 hyb.조건이나 노하우가 있으신분의 도움 부탁드립니다. 지나가다가 들려서 답변해드립니다. ^^;; 우선 whole genome을 amplication하셨다면 충분히 denature 시켜줘야 합니다... 보통 끓이죠.. 그리고 온도의 변화가 없이 바로 slide에 놓고.. chamber로 넣어두는데... 모든 시약을 다 넣은 상태에서 chamber를 끓이거나, hybridization temp을 40, 50, 60 도 이런식으로 해보시는 것이 좋을 것 같습니다. 그리고 whole genome이 양이 많다면.. 좀.. 그렇겠죠... 아무래도 점성이 많을 것이니깐... whole genome 혹은 metagenome을 array에 실어서 실험한 결과가 최근에 publish 되었습니다~ 찾아보심이 좋을 것 같네요~~
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