지식나눔

Pulsed-field gel electrophoresis

새송이 버섯(Pleurotus eryngii)의 karyotype을 확인하기 위해 CHEF Mapper XA System을 이용해 실험을 하고 있는 학생입니다. CHEF Mapper XA System 같은 경우 확인하고자 하는 핵산의 size를 주어주면 전류의 세기, 시간, buffer의 종류, gel의 종류, % 등을 자동으로 잡게되는데요 이렇게 주어진 조건으로 electrophoresis를 하게 되면 이전에는 marker라도 잘 나오던 것들이 갑자기 marker도 나오지 않고 있습니다 도대체 무엇이 잘못된 것일까요?? 참 제가 확인하고자 하는 핵산의 size는 약 5.7Mb ~ 1.5Mb정도 됩니다. 그리고 marker는 S. pombe(5.7Mb, 4.6Mb, 3.5Mb)와 H. wingei(3.13Mb, 2.70Mb, 2.35Mb, 1.81Mb, 1.66Mb, 1.37Mb, 1.05Mb)를 사용하고 있습니다. 원인을 아시는 분은 답변 좀 부탁드립니다. 그리고 혹시 CHEF를 이용해 곰팡이(버섯)나 Eukaryote 쪽으로 Pulsed-field gel electrophoresis를 하여 chromosomal DNA size를 확인하는 실험이나 이와 비슷한 실험을 하시는 분은 hee821003@naver.com으로 연락을 주시면 대단히 감사하겠습니다
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답변 1
  • 답변

    안길홍님의 답변

    >새송이 버섯(Pleurotus eryngii)의 karyotype을 확인하기 위해 >>CHEF Mapper XA System을 이용해 실험을 하고 있는 학생입니다.>>CHEF Mapper XA System 같은 경우 확인하고자 하는 핵산의 size를 주어주면 >>전류의 세기, 시간, buffer의 종류, gel의 종류, % 등을 자동으로 잡게되는데요 >>이렇게 주어진 조건으로 electrophoresis를 하게 되면 >>이전에는 marker라도 잘 나오던 것들이 갑자기 marker도 나오지 않고 있습니다>>도대체 무엇이 잘못된 것일까요??>>참 제가 확인하고자 하는 핵산의 size는 약 5.7Mb ~ 1.5Mb정도 됩니다.>>그리고 marker는 S. pombe(5.7Mb, 4.6Mb, 3.5Mb)와 H. wingei(3.13Mb, 2.70Mb, >>2.35Mb, 1.81Mb, 1.66Mb, 1.37Mb, 1.05Mb)를 사용하고 있습니다.>>원인을 아시는 분은 답변 좀 부탁드립니다. >>그리고 혹시 CHEF를 이용해 곰팡이(버섯)나 Eukaryote 쪽으로 Pulsed-field gel >>electrophoresis를 하여 chromosomal DNA size를 확인하는 실험이나 이와 비슷한 >>실험을 하시는 분은 hee821003@naver.com으로 연락을 주시면 대단히 감사하겠습니다 첨부자료
    >새송이 버섯(Pleurotus eryngii)의 karyotype을 확인하기 위해 >>CHEF Mapper XA System을 이용해 실험을 하고 있는 학생입니다.>>CHEF Mapper XA System 같은 경우 확인하고자 하는 핵산의 size를 주어주면 >>전류의 세기, 시간, buffer의 종류, gel의 종류, % 등을 자동으로 잡게되는데요 >>이렇게 주어진 조건으로 electrophoresis를 하게 되면 >>이전에는 marker라도 잘 나오던 것들이 갑자기 marker도 나오지 않고 있습니다>>도대체 무엇이 잘못된 것일까요??>>참 제가 확인하고자 하는 핵산의 size는 약 5.7Mb ~ 1.5Mb정도 됩니다.>>그리고 marker는 S. pombe(5.7Mb, 4.6Mb, 3.5Mb)와 H. wingei(3.13Mb, 2.70Mb, >>2.35Mb, 1.81Mb, 1.66Mb, 1.37Mb, 1.05Mb)를 사용하고 있습니다.>>원인을 아시는 분은 답변 좀 부탁드립니다. >>그리고 혹시 CHEF를 이용해 곰팡이(버섯)나 Eukaryote 쪽으로 Pulsed-field gel >>electrophoresis를 하여 chromosomal DNA size를 확인하는 실험이나 이와 비슷한 >>실험을 하시는 분은 hee821003@naver.com으로 연락을 주시면 대단히 감사하겠습니다 첨부자료
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