지식나눔

virus에 관한 논문을 보면서 궁금한게 있어서 질문드립니다.

처음으로 virus에 관한 논문을 읽으면서 모르는게 많아 여기에 글을 올립니다. 1. virus factory라는 말이 많이 나오는데, 정확히 이해가 안갑니다. 2. virus를 western blot을 찍기 위해 mouse antiserum을 만들었다는데 antibody랑 뭐가 다른지 어떻게 만드는지 알고 싶습니다. 3. 실험 중에 virus의 ct value PCR을 통해서 값이 나오는데, 이게 무엇인지 모르겠고, 그 값의 의미도 모르겠습니다. 4. ORFan의 의미는 대충 알겠는데, 더 자세히 알고 싶습니다. 5. 혹시나 virus 실험 하시는 분이 있으시면, 기본적인 virus 발견, 분리 법을 알려주세요. 6. eclips phase가 뭔가요? 어이없는 질문일 수도 있겠지만 좋은 답변 부탁드립니다.
  • virus factory
  • ct value
  • antiserum
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답변 1
  • 답변

    송재민님의 답변

    1. virus factory는 바이러스가 숙주세포 내에서 자신을 효과적으로 복제를 하기 위해 세포 내 구성성분들을 활용하는데 이 과정중에 organelles, scaffold 등을 이용하여 만들어지는 특이적인 구성체를 virus factory라고 합니다. 2. 보통 상용화되어 있는 antibody가 없을 경우 이를 대신하여 목적하는 단백질을 마우스에 주사한 후 혈청에 존재하는 항원을 활용합니다. 아마도 그래서 antibody라 칭하지 않고 antiserum 이라 명한 것 같네요. 3. ct value(Cycle Threshold)는 흔히 real time PCR을 통해 바이러스 유전자를 정량하고자 할때 사용하는데 개념적으로 정해진 양의 DNA에 도달하는 시간(?) 이라고 생각하면 크게 틀리지 않습니다. initial DNA가 많으면 빠른시간에 일정량의 유전자 증폭이 이뤄지겠지요.. 4. ORFans에 대해 선 저도 별로 아는 바가 없지만 질문이 무엇인지도 잘 모르겠네요. 5. 기본적인 바이러스 발견법이라는건 검출법을 말씀하시는 것 같은데 보통 PCR 이나 상용화된 kit가 있으면 이를 많이들 이용하지요. 분리법.. 좀 애매한 질문인데 고순도의 바이러스를 분리하려면 보통 수크로즈 농도구배를 이용한 초원심분리법을 많이 사용하고, 숙주에서의 분리를 의미하면 적합한 장기를 적출한 후 다시 세포배양 통해 바이러스를 분리합니다. 6. 바이러스가 기하급수적으로 증식하기 이 전 단계로 바이러스 입장에서는 숙주세포 내 환경을 자신의 복제에 유리하도록 준비하는 단계입니다. 질문이 어의없지는 않은데 보통 좋은 질문에 좋은 답변이 달리는 것 같습니다. >처음으로 virus에 관한 논문을 읽으면서 모르는게 많아 여기에 글을 올립니다. > >1. virus factory라는 말이 많이 나오는데, 정확히 이해가 안갑니다. > >2. virus를 western blot을 찍기 위해 mouse antiserum을 만들었다는데 > antibody랑 뭐가 다른지 어떻게 만드는지 알고 싶습니다. > >3. 실험 중에 virus의 ct value PCR을 통해서 값이 나오는데, > 이게 무엇인지 모르겠고, 그 값의 의미도 모르겠습니다. > >4. ORFan의 의미는 대충 알겠는데, 더 자세히 알고 싶습니다. > >5. 혹시나 virus 실험 하시는 분이 있으시면, 기본적인 virus 발견, 분리 법을 > 알려주세요. > >6. eclips phase가 뭔가요? > >어이없는 질문일 수도 있겠지만 좋은 답변 부탁드립니다.
    1. virus factory는 바이러스가 숙주세포 내에서 자신을 효과적으로 복제를 하기 위해 세포 내 구성성분들을 활용하는데 이 과정중에 organelles, scaffold 등을 이용하여 만들어지는 특이적인 구성체를 virus factory라고 합니다. 2. 보통 상용화되어 있는 antibody가 없을 경우 이를 대신하여 목적하는 단백질을 마우스에 주사한 후 혈청에 존재하는 항원을 활용합니다. 아마도 그래서 antibody라 칭하지 않고 antiserum 이라 명한 것 같네요. 3. ct value(Cycle Threshold)는 흔히 real time PCR을 통해 바이러스 유전자를 정량하고자 할때 사용하는데 개념적으로 정해진 양의 DNA에 도달하는 시간(?) 이라고 생각하면 크게 틀리지 않습니다. initial DNA가 많으면 빠른시간에 일정량의 유전자 증폭이 이뤄지겠지요.. 4. ORFans에 대해 선 저도 별로 아는 바가 없지만 질문이 무엇인지도 잘 모르겠네요. 5. 기본적인 바이러스 발견법이라는건 검출법을 말씀하시는 것 같은데 보통 PCR 이나 상용화된 kit가 있으면 이를 많이들 이용하지요. 분리법.. 좀 애매한 질문인데 고순도의 바이러스를 분리하려면 보통 수크로즈 농도구배를 이용한 초원심분리법을 많이 사용하고, 숙주에서의 분리를 의미하면 적합한 장기를 적출한 후 다시 세포배양 통해 바이러스를 분리합니다. 6. 바이러스가 기하급수적으로 증식하기 이 전 단계로 바이러스 입장에서는 숙주세포 내 환경을 자신의 복제에 유리하도록 준비하는 단계입니다. 질문이 어의없지는 않은데 보통 좋은 질문에 좋은 답변이 달리는 것 같습니다. >처음으로 virus에 관한 논문을 읽으면서 모르는게 많아 여기에 글을 올립니다. > >1. virus factory라는 말이 많이 나오는데, 정확히 이해가 안갑니다. > >2. virus를 western blot을 찍기 위해 mouse antiserum을 만들었다는데 > antibody랑 뭐가 다른지 어떻게 만드는지 알고 싶습니다. > >3. 실험 중에 virus의 ct value PCR을 통해서 값이 나오는데, > 이게 무엇인지 모르겠고, 그 값의 의미도 모르겠습니다. > >4. ORFan의 의미는 대충 알겠는데, 더 자세히 알고 싶습니다. > >5. 혹시나 virus 실험 하시는 분이 있으시면, 기본적인 virus 발견, 분리 법을 > 알려주세요. > >6. eclips phase가 뭔가요? > >어이없는 질문일 수도 있겠지만 좋은 답변 부탁드립니다.
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