2009-02-26
org.kosen.entty.User@653d23b9
박기수(kisoo)
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DNA aptamer 가 target 과 반응시 형성되는
Quadruplex 형성 여부를 Circular dichroism 으로 측정하려고 하는데
DNA aptamer 농도는 얼마에 CD 측정을 위한 volume 은 얼마나 필요한지
알고 싶어서 글을 남기게 되었습니다.
관련 논문이나 circular dichroism 을 이용하여
DNA 구조 변화를 측정한 논문이 있음 가려주세요
- Circular Dichroism
- Quadruplex
- DNA aptamer
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답변 2
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답변
고문주님의 답변
2009-02-27- 0
일단 측정 조건은 잔기 기준 몰농도 2.691 mM,25℃、pH7.5、20mM KPi、100mM KCl、10% glycerol 이라고 합니다. 측정후 피크를 분석해 보면, 209nm ： α헬릭스의π->π* 전이 222nm ： α헬릭스의n->π* 전이 218nm ： β스트렌드 라고 합니다. mole ellipticity를 구하실때, ellipticity에 몰농도와 석영셀의 길이를 나눠 주기 때문에 위의 조건과 비슷한 몰농도로 샘플을 만드신 후 몰농도로 나눠 주시면 되겟습니다. 꼭 위와몰농도는 달라도 샘플의 정확한 몰농도를 계산 하셔야 합니다. 또한, 석영 셀의 경우 간격이 1cm, 0.1cm 아무 거나 상관이 없습니다. 어차피 계산할때 나눠주는 값이 달라지기 때문이죠. 가지고 계신 셀에따라서 볼륨은 달라지리라 생각합니다. 물론.. 209nm정도까지 관찰 하실 목적이시라면 석영 셀을 사용하셔야 겟죠? -
답변
신재욱님의 답변
2009-03-06- 0
아래의 논문이 도움이 되실런지.... http://www.pubmedcentral.nih.gov/picrender.fcgi?artid=327729&blobtype=pdf