2009-03-10
org.kosen.entty.User@bc43822
김정근(baramnamoo)
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제가 확실히 무엇인지 알지 못하는 곰팡이를 연구하게 되었습니다.
형태적이나 균사, 포자 등을 봤을 때는 유사한 균이 있습니다만,
확실히 이 균이 무엇인지 어떻게 알아내야 할지 의문입니다.
18s ribosomal DNA를 통한 분석은 16s에 비해
유사성이 많이 떨어지는 것으로 알고 있고,
단순히 DNA를 뽑아서 sequencing을 해서 봐야하는지
아니면 어떤 다른 동정 방법이 있는지 알고싶습니다.
- 곰팡이 동정
- sequencing
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 1
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답변
신재욱님의 답변
2009-03-10- 2
동정하기 가장 어려운 미생물이 곰팡이입니다. 먼저 형태학적인 관찰을 기본적으로 해야 합니다. Canidia나 유성생식포자를 만드는 경우에 가능합니다. 염기서열은 database가 축적되어져 있는 Trichoderma나 Colletotrichum 같은 일부의 균의 경우에 ITS부분의 염기서열로 종까지는 가능은 합니다. 곰팡이의 경우 분류군에 따라 종 내 유사도 또한 다양하게 나타나기 때문에 종 동정을 위한 절대적인 염기서열 유사도의 기준치는 존재하지 않습니다. 속의 경우는 대부분 26S rDNA의 D1/D2 부분의 염기서열 결정으로 동정이 가능합니다.