2009-10-28
org.kosen.entty.User@a08fe15
박지윤(smile)
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첨부파일
안녕하세요.
다름이 아니라, SNP에 대해 여쭙니다.
첨부된 모든 서열은 41개 염기서열을 갖고 있는데, 21번째 부위에 SNP site를 모두
갖고 있습니다. 어떻게 이와 같은 SNP를 검색할 수 있을지요?
제가, 이쪽 분야로는 잘 알지 못해서 여쭙니다.
회신 주시면, 감사하겠습니다.
- SNP
- polymorphisim
- marker
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 1
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답변
장성재님의 답변
2009-10-29- 0
아시다시피 SNP란 single nucleotide polymorphism의 약자로써 의미 그대로 단일 염기 다형성, 즉, 핵산을 구성하는 단위인 염기 (A, T, G, C) 서열 중에 하나의 염기 서열의 차이에 의해서 일어나는 다양성을 뜻합니다. 한 예로써, 이러한 단일 염기 서열의 차이에 의해서 핵산이 암호하고 있는 단백질의 번역 과정 (frame shift에 의해서 전혀 다른 아미노산 서열을 가진 단백질이 생산되거나 번역과정이 도중에 멈추게 됨)에서 차이를 보임으로 인해 단백질의 기능이 불완전 혹은 기능을 상실한 경우 등의 특정 질병관의 연관성이 보고됨으로써 시작된 것으로 한 가지의 유전자에 대해서도 매우 인종, 성별, 가족관계 등에 따라서 다양한 SNP들이 보고 되고 있습니다. 즉, 유전체의 전체 염기 서열을 확인하지 않는 한 SNP를 확인하는 것은 어렵습니다. 다만, 최근에는 국제적인 콘소시엄을 비롯하여 많은 비영리 단체들이 SNP 데이터베이스들을 공개하고 있기 때문에 원하시는 질병과 관련된 특정 유전자의 SNP 데이터를 손쉽게 구하실 수 있습니다. 대표적으로 미국의 NIH에서 운영하고 있는 public database 내의 dbSNP에서 특정 유전자의 기호를 입력하시면 손쉽게 자료를 구하실 수 있습니다 (www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=Snp). 또한, 특정 질병 및 유전자에 연관된 SNP를 조사하는 방법들도 다양하게 개발되어 있으므로, 좀더 구체적인 정보를 원하실 경우 쪽지를 보내주시길 바랍니다. 능력이 되는 한도 내에서 도움을 드리겠습니다. > 안녕하세요. > 다름이 아니라, SNP에 대해 여쭙니다. > 첨부된 모든 서열은 41개 염기서열을 갖고 있는데, 21번째 부위에 SNP site를 모두 > 갖고 있습니다. 어떻게 이와 같은 SNP를 검색할 수 있을지요? > > 제가, 이쪽 분야로는 잘 알지 못해서 여쭙니다. > 회신 주시면, 감사하겠습니다. >