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polyketide/non-ribosomal peptide analysis

세균에서 polyketide/non ribosomal peptide 분리하기 위해 여러번의 컬럼 work 을 통하여 normal phase 에서 Bu:Me:W (4:1:2) 조건으로 전개 하였을 때 active compound 가 분리가 되고, Bio-Autography 에서도 활성 부위가 검출이 되었는데 Reverse phase 에서 도저히 조건이 안 잡힙니다. 우선 Butanol 을 쓸 수가 없기에, Me 과 ACN 을 각각 Water 과 Gradient 하여 전개 해 보았지만 역시 50% ANC 에서만 올라갔고, 활성부위가 검출 안되었습니다. 혹.. 관련하여 고수님들의 용매 선정부터 많은 조언 부탁 드립니다. 참고로 antifungal activity 로 bio-autography 했습니다.
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답변 1
  • 답변

    이상후님의 답변

    >세균에서 polyketide/non ribosomal peptide 분리하기 위해 여러번의 컬럼 work 을 통하여 normal phase 에서 Bu:Me:W (4:1:2) 조건으로 전개 하였을 때 active compound 가 분리가 되고, Bio-Autography 에서도 활성 부위가 검출이 되었는데 Reverse phase 에서 도저히 조건이 안 잡힙니다. 우선 Butanol 을 쓸 수가 없기에, Me 과 ACN 을 각각 Water 과 Gradient 하여 전개 해 보았지만 역시 50% ANC 에서만 올라갔고, 활성부위가 검출 안되었습니다. >혹.. 관련하여 고수님들의 용매 선정부터 많은 조언 부탁 드립니다. >참고로 antifungal activity 로 bio-autography 했습니다. 우선 Plate 자체를 C18 reverse-phase 를 사용해 보세요. Reverse-phase mode에서는 단순 isocratic으로는 쉽게 분리가 안될 것입니다. 분석 물질 자체가 peptide계열이기 때문이죠..따라서 0.05% formic acid를 소량 첨가한 물에 5-95% ACN(v/v)으로 gradient로 테스트를 해보시기 바랍니다.
    >세균에서 polyketide/non ribosomal peptide 분리하기 위해 여러번의 컬럼 work 을 통하여 normal phase 에서 Bu:Me:W (4:1:2) 조건으로 전개 하였을 때 active compound 가 분리가 되고, Bio-Autography 에서도 활성 부위가 검출이 되었는데 Reverse phase 에서 도저히 조건이 안 잡힙니다. 우선 Butanol 을 쓸 수가 없기에, Me 과 ACN 을 각각 Water 과 Gradient 하여 전개 해 보았지만 역시 50% ANC 에서만 올라갔고, 활성부위가 검출 안되었습니다. >혹.. 관련하여 고수님들의 용매 선정부터 많은 조언 부탁 드립니다. >참고로 antifungal activity 로 bio-autography 했습니다. 우선 Plate 자체를 C18 reverse-phase 를 사용해 보세요. Reverse-phase mode에서는 단순 isocratic으로는 쉽게 분리가 안될 것입니다. 분석 물질 자체가 peptide계열이기 때문이죠..따라서 0.05% formic acid를 소량 첨가한 물에 5-95% ACN(v/v)으로 gradient로 테스트를 해보시기 바랍니다.

    알겠습니다 .. 그리고 .. 결과보고 댓글 달도록 하겠습니다 ..
    참고로 물질 검출은 Ninhydrin 방법을 병행 했었는데 ..