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지식나눔

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천연물 스크리닝

2010-05-05 org.kosen.entty.User@621acd98 이승규(sklee0125)
  • 3
천연물 추출한 것을 분획하면서 생물학적 assay를 하고자 하는데요. 초기 단계에서 추출물이 활성이 있는지를 확인하고자 할 때, 나타난 활성이 non-specific binding인지의 여부를 어떻게 확인할 수 있을까요?
  • 천연물 과학
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답변 3
  • 답변

    강동호님의 답변

    2010-05-06
    • 0
    >천연물 추출한 것을 분획하면서 생물학적 assay를 하고자 하는데요. > >초기 단계에서 추출물이 활성이 있는지를 확인하고자 할 때, > >나타난 활성이 non-specific binding인지의 여부를 어떻게 확인할 수 있을까요? assay method가 무엇인지 모르는 상태에서 정확한 답변이 어려울 것 같고, 대부분의 경우, 천연물 분획단계에서는 활성 평가만을 하고, binding 여부는 단일물질에서 가능할 수 도 있을 것 같습니다.
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    >천연물 추출한 것을 분획하면서 생물학적 assay를 하고자 하는데요. > >초기 단계에서 추출물이 활성이 있는지를 확인하고자 할 때, > >나타난 활성이 non-specific binding인지의 여부를 어떻게 확인할 수 있을까요? assay method가 무엇인지 모르는 상태에서 정확한 답변이 어려울 것 같고, 대부분의 경우, 천연물 분획단계에서는 활성 평가만을 하고, binding 여부는 단일물질에서 가능할 수 도 있을 것 같습니다.
    이승규(sklee0125) 2010-05-06

    만약 분획하는 중에 활성이 없어진다면, 추출 윗 단계에서의 활성이 non-specific binding 이었어거나 물질들의 복합적 작용인해 생긴 것으로 생각해도 되는 것인가요? 혹시 초기 추출 단계에서 농도 의존적 반응실험을 통해 non-specific binding의 여부를 판단할 수는 없습니까?

  • 답변

    이상후님의 답변

    2010-05-06
    • 0
    >천연물 추출한 것을 분획하면서 생물학적 assay를 하고자 하는데요. > >초기 단계에서 추출물이 활성이 있는지를 확인하고자 할 때, > >나타난 활성이 non-specific binding인지의 여부를 어떻게 확인할 수 있을까요? 천연물이 단백질 효소나 펩타이드가 아니라면 non-specific binding의 가능성은 있을 수 있습니다. 만약 단백질이나 펩타이드가 아니라면 activity가 나타나는 분획만을 분리해서 그 자체를 세밀히 조사해 보는 방법이 있습니다. 예를들어, 원치않는 당 성분이 결합되어 있다든지 할 경우에는 phenol-sulfric acid assay로 발색반응이 나오는지 확인이 가능하고, metal ion이 binding되어 있을 경우에는 metal ion specific assay법으로 확인해보면 될 거 같습니다. 정제과정중에 activity가 낮아지는것은 사실입니다. 이럴 경우, 정제법을 바꿔보신다거나 crude 액 자체를 직접 테스트해보시는건 어떨런지요..
    답변수정
    >천연물 추출한 것을 분획하면서 생물학적 assay를 하고자 하는데요. > >초기 단계에서 추출물이 활성이 있는지를 확인하고자 할 때, > >나타난 활성이 non-specific binding인지의 여부를 어떻게 확인할 수 있을까요? 천연물이 단백질 효소나 펩타이드가 아니라면 non-specific binding의 가능성은 있을 수 있습니다. 만약 단백질이나 펩타이드가 아니라면 activity가 나타나는 분획만을 분리해서 그 자체를 세밀히 조사해 보는 방법이 있습니다. 예를들어, 원치않는 당 성분이 결합되어 있다든지 할 경우에는 phenol-sulfric acid assay로 발색반응이 나오는지 확인이 가능하고, metal ion이 binding되어 있을 경우에는 metal ion specific assay법으로 확인해보면 될 거 같습니다. 정제과정중에 activity가 낮아지는것은 사실입니다. 이럴 경우, 정제법을 바꿔보신다거나 crude 액 자체를 직접 테스트해보시는건 어떨런지요..
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  • 답변

    구경아님의 답변

    2010-05-07
    • 0
    >천연물 추출한 것을 분획하면서 생물학적 assay를 하고자 하는데요. > >초기 단계에서 추출물이 활성이 있는지를 확인하고자 할 때, > >나타난 활성이 non-specific binding인지의 여부를 어떻게 확인할 수 있을까요? 추출물은 활성을 가진 다양한 종류의 물질과 더불어 활성을 가지지 않는 다양한 물질들이 수만가지 수천가지 혼재한 상태입니다. 그 추출물이 assay에서 활성을 보인다는 의미는 활성을 가진 물질이 다량 혹은 다수의 물질들을 함유하고 있다는 점입니다. 이 활성 추출물을 가지고 분획을 나누어 활성을 추적해 가다보면, 다량 존재하는 물질이 활성물질일 경우는 활성물질로 확인/분석하기 쉬운데, 다수의 물질 즉 화학구조가 유사하면서 종류가 다양한 물질들이 활성을 나타내는 경우는 분획하여 추적하는 과정에 활성이 흩어지는 경우를 종종 볼 수 있습니다. 이렇게 장황하게 설명하는 이유은 물론 추출물을 가지고 non-specific binding 여부를 측정하는건 가능합니다. 그러나 워낙 많은 물질들이 혼재해 있기 때문에 활성여부를 binding force만으로 설명하시기에는 다소 무리가 있습니다. 다시 말해 추출물 수준에서 non-specific binding 여부를 확인하는게 활성물질의 개발 측면에서는 별로 의미없다는 점이고, 추출물의 효능을 설명하고자 하는 측면에서는 약간의 의미를 부여 할 수 있습니다. 그러나 활성 물질을 온전하게 분석하였을때는 추출물의 non-specific binding에 대한 결과가 전혀 의미가 없는 경우를 접할 수 있습니다.
    답변수정
    >천연물 추출한 것을 분획하면서 생물학적 assay를 하고자 하는데요. > >초기 단계에서 추출물이 활성이 있는지를 확인하고자 할 때, > >나타난 활성이 non-specific binding인지의 여부를 어떻게 확인할 수 있을까요? 추출물은 활성을 가진 다양한 종류의 물질과 더불어 활성을 가지지 않는 다양한 물질들이 수만가지 수천가지 혼재한 상태입니다. 그 추출물이 assay에서 활성을 보인다는 의미는 활성을 가진 물질이 다량 혹은 다수의 물질들을 함유하고 있다는 점입니다. 이 활성 추출물을 가지고 분획을 나누어 활성을 추적해 가다보면, 다량 존재하는 물질이 활성물질일 경우는 활성물질로 확인/분석하기 쉬운데, 다수의 물질 즉 화학구조가 유사하면서 종류가 다양한 물질들이 활성을 나타내는 경우는 분획하여 추적하는 과정에 활성이 흩어지는 경우를 종종 볼 수 있습니다. 이렇게 장황하게 설명하는 이유은 물론 추출물을 가지고 non-specific binding 여부를 측정하는건 가능합니다. 그러나 워낙 많은 물질들이 혼재해 있기 때문에 활성여부를 binding force만으로 설명하시기에는 다소 무리가 있습니다. 다시 말해 추출물 수준에서 non-specific binding 여부를 확인하는게 활성물질의 개발 측면에서는 별로 의미없다는 점이고, 추출물의 효능을 설명하고자 하는 측면에서는 약간의 의미를 부여 할 수 있습니다. 그러나 활성 물질을 온전하게 분석하였을때는 추출물의 non-specific binding에 대한 결과가 전혀 의미가 없는 경우를 접할 수 있습니다.
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