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지식나눔

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아미노산 서열로 부터 domain찾는 법

2010-07-09 org.kosen.entty.User@49469ce5 민병걸(minbgj1108)
  • 2
아미노산 서열을 알고 있는데.. 이것이 어떤 domain인지..혹은 어떤 family에 속해있는지.. 이런것 알 수 있는 법 있나요??ㅠㅠ
  • domain
  • 아미노산
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답변 2
  • 답변

    이영삼님의 답변

    2010-07-10
    • 0
    >아미노산 서열을 알고 있는데.. >이것이 어떤 domain인지..혹은 어떤 family에 속해있는지.. >이런것 알 수 있는 법 있나요??ㅠㅠ 여러 웹 프로그램들이 있는데요, 개인적으로는 PFAM을 주로 씁니다. http://pfam.sanger.ac.uk/ 으로 가셔서 SEQUENCE SEARCH 를 클릭한 후, 아미노산 서열을 써 주면 도메인을 찾아줍니다. 그외에도 http://www.expasy.org/tools/ 로 가서 Pattern and profile searches를 보시면 비슷한 웹사이트들을 링크해놓았습니다. 마지막으로 BLAST (www.ncbi.nlm.nih.gov/blast)에서 BLAST-P를 이용하면 conserved domain을 보여주기도 합니다.
    답변수정
    >아미노산 서열을 알고 있는데.. >이것이 어떤 domain인지..혹은 어떤 family에 속해있는지.. >이런것 알 수 있는 법 있나요??ㅠㅠ 여러 웹 프로그램들이 있는데요, 개인적으로는 PFAM을 주로 씁니다. http://pfam.sanger.ac.uk/ 으로 가셔서 SEQUENCE SEARCH 를 클릭한 후, 아미노산 서열을 써 주면 도메인을 찾아줍니다. 그외에도 http://www.expasy.org/tools/ 로 가서 Pattern and profile searches를 보시면 비슷한 웹사이트들을 링크해놓았습니다. 마지막으로 BLAST (www.ncbi.nlm.nih.gov/blast)에서 BLAST-P를 이용하면 conserved domain을 보여주기도 합니다.
    등록된 댓글이 없습니다.
  • 답변

    이재옥님의 답변

    2010-08-12
    • 0
    PROSITE database http://www.expasy.org/prosite InterPro http://www.ebi.ac.uk/interpro/ >아미노산 서열을 알고 있는데.. >이것이 어떤 domain인지..혹은 어떤 family에 속해있는지.. >이런것 알 수 있는 법 있나요??ㅠㅠ
    답변수정
    PROSITE database http://www.expasy.org/prosite InterPro http://www.ebi.ac.uk/interpro/ >아미노산 서열을 알고 있는데.. >이것이 어떤 domain인지..혹은 어떤 family에 속해있는지.. >이런것 알 수 있는 법 있나요??ㅠㅠ
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