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현재 박사과정 이등병, 초짜생 대학원생입니다.
아직 미숙한 학생입니다.
궁금한 점, 호기심이 생겼는데 아직 부족하여 어떠한 것을 공부해야 하는지
어떠한 실험들이 있는지 그 길조차 보이지 않아서 여러 선배님들께 자문을 구하고자 합니다.
RNA 서열 상의 차이가 있는 2개( 혹은 그 이상의 cell line)를 서로 비교하여 그 차이를
인위적으로 조작 혹은 mutation 등을 시켜서 확인하고 싶습니다. 이럴 때에
시도해 볼 수 있는 실험은 무엇이 있나요?
RNA 서열의 특정 부분만을 mutation 시킬 수가 있나요?
아니면 특정 부분은 siRNA로 Knock down 시키고 비교하는 것이 타당한가요?
- RNA
- next generation sequencing
- mutation
각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변
김상우님의 답변
2011-07-28- 0
많은 도움은 되지 않겠지만 조금이나마 공부하시는데 길이되고자 첨부 논문과 함께 몇자 적습니다.
Mutation을 일으켜서 보고자하는것이 적확하게 파악이 되지 않지만 현재 RNA에 관련으로 실험되고 있는 실험 경향으로는 첨부해드린 nature 논문을 참고하시면 될것 같구요. RNA 기능을 알고자 하는 실험이라면 말씀하신데로 siRNA knock down 실험 또는 knockout mice 실험들을 할 수 있겠네요. knockout mice의 경우 실험의 시간이 오래 걸리는 관계로 보통 in vitro상에서 하는 siRNA 실험을 주로 먼저 수행하고 2차 확인 작없으로 mice 실험을 하는 실험자들이 있습니다. 또는 여건이 된다면 동시에 실험을 하는 경우도 있구요.
단지 종간의 유전자상의 변의차를 보시고 싶다면 요즘 많이 이루어지고 있는 시퀀싱을 통해 비교 분석하고 차후 결과에 대한 확인 실험을 첨부해드린 실험에 종류로 확인하시면 될것 같습니다.
그럼...좋은 결과 있으시길....
-------------------------------------질문-------------------------------------
현재 박사과정 이등병, 초짜생 대학원생입니다.
아직 미숙한 학생입니다.
궁금한 점, 호기심이 생겼는데 아직 부족하여 어떠한 것을 공부해야 하는지
어떠한 실험들이 있는지 그 길조차 보이지 않아서 여러 선배님들께 자문을 구하고자 합니다.
RNA 서열 상의 차이가 있는 2개( 혹은 그 이상의 cell line)를 서로 비교하여 그 차이를
인위적으로 조작 혹은 mutation 등을 시켜서 확인하고 싶습니다. 이럴 때에
시도해 볼 수 있는 실험은 무엇이 있나요?
RNA 서열의 특정 부분만을 mutation 시킬 수가 있나요?
아니면 특정 부분은 siRNA로 Knock down 시키고 비교하는 것이 타당한가요?