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지식나눔

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새로운 SNP를 찾았는데 SNP 번호를 어떻게 부여하나요?

2012-01-04 org.kosen.entty.User@443c5e6e 이인석(thssla)
  • 1

어떤 gene을 PCR과 direct sequencing을 수행해서 기존에 알려저 있는 않은 곳에서 SNP를

 

발견했습니다. 논문에 SNP 번호 or calling을 하려고 하는데 어떻게 부여하나요?

 

그리고 논문에 어떻게 display하는것이 좋은지 알고 싶습니다.

 

감사합니다.

  • SNP
  • SNP calling
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답변 1
  • 답변

    황규찬님의 답변

    2012-01-05
    • 2

    우선 여러번 실험을 통해 mutation(전체 개체간에서 통상적으로 1%이하)인지 SNP(전체 개체간에서 통상적으로 1%이상, 남들에게 알렸을때 흥미를 가지겠죠!)인지를 확인하세요. SNP이라고 판단이 된다면, 공인을 받아야 합니다. 공인을 받는 방법은 제일 쉬운것이 GenBank에서 accession number를 부여 받는 겁니다. 부여 받기 위해서는 여러 방법이 있지만, 가장 쉬운 방법은  Banklt 프로그램 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/?tool=genbank)을 활용하는겁니다. 자세한 것은 홈페이지에 가서 살퍼보시기 바랍니다. SNP을 submission하면 바로 몇주내로 SNP accession number를 부여 받습니다. 이 GenBank 번호로 논문에 사용하시면 됩니다.

    답변수정

    우선 여러번 실험을 통해 mutation(전체 개체간에서 통상적으로 1%이하)인지 SNP(전체 개체간에서 통상적으로 1%이상, 남들에게 알렸을때 흥미를 가지겠죠!)인지를 확인하세요. SNP이라고 판단이 된다면, 공인을 받아야 합니다. 공인을 받는 방법은 제일 쉬운것이 GenBank에서 accession number를 부여 받는 겁니다. 부여 받기 위해서는 여러 방법이 있지만, 가장 쉬운 방법은  Banklt 프로그램 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/?tool=genbank)을 활용하는겁니다. 자세한 것은 홈페이지에 가서 살퍼보시기 바랍니다. SNP을 submission하면 바로 몇주내로 SNP accession number를 부여 받습니다. 이 GenBank 번호로 논문에 사용하시면 됩니다.

    이인석(thssla) 2012-01-05

    소중한 정보 정말 감사합니다.

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