지식나눔

aptamer analysis

aptamer와 samll protein을 conjugation 시킨 후 HPLC로 분리하려고 하는데 어떤 컬럼을 사용해야 하나요? 분자량은 대략 10000 정도 되는데 RP C18 column을 사용해서 분리가 가능한가요? 그리고 이걸 mass로 확인하려고 하는데 MALDI, ESI 중 어떤 것이 더 적합한가요?
  • aptamer
  • HPLC
  • Mass
지식의 출발은 질문, 모든 지식의 완성은 답변! 
각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
답변 1
  • 답변

    최선규님의 답변

    HPCL에서 보통 peptide를 분리 할때는 C18을 사용하고 protein을 분리 할때는 C4 혹은 C8 컬럼을 사용 합니다. 하지만 10000 Da정도의 작은 사이즈라서 C18도 잘 분리 할 수 있을것 같습니다. 정확한 분자량을 측정 하길 원한다면 ESI-FTICR 이나 ESI-orbitrap mass spectrometry를 사용 하시는것이 좋습니다. 대충의 분자량을 측정하길 원하시면 MALDI에서도 분석 가능합니다. ㄱ러나 aptamer가 negative charge를 갖고 있어서 감도가 좋은 mass spectrometry를 사용 하시는것이 좋을 것 같습니다. 더 자세한 사항은 한국기초과학지원 연구원 질량분석연구부에 문의 하시면 실제 시료분석에 대해서 더 자세히 알 수 있습니다.
    HPCL에서 보통 peptide를 분리 할때는 C18을 사용하고 protein을 분리 할때는 C4 혹은 C8 컬럼을 사용 합니다. 하지만 10000 Da정도의 작은 사이즈라서 C18도 잘 분리 할 수 있을것 같습니다. 정확한 분자량을 측정 하길 원한다면 ESI-FTICR 이나 ESI-orbitrap mass spectrometry를 사용 하시는것이 좋습니다. 대충의 분자량을 측정하길 원하시면 MALDI에서도 분석 가능합니다. ㄱ러나 aptamer가 negative charge를 갖고 있어서 감도가 좋은 mass spectrometry를 사용 하시는것이 좋을 것 같습니다. 더 자세한 사항은 한국기초과학지원 연구원 질량분석연구부에 문의 하시면 실제 시료분석에 대해서 더 자세히 알 수 있습니다.
    등록된 댓글이 없습니다.