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답변 3
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답변
황규찬님의 답변
2015-08-17- 2
게놈(지놈; genome)이 밝혀져 등록(ncbi) 되어 있는 경우와 그렇지 않은 경우에 따라,
1) 등록되어 있는 경우
밝혀진 유전자 혹은 알고 있는 서열을 이용하여 직접 primer를 디자인한후, subcloning하여 sequencing으로 확인하는 방법
2) 게놈 서열을 모를 경우
microsatellite 마커를 구입하여 기존에 동정한 미생물의 게놈과 확인하고 싶은 미생물의 게놈을 비교 분석하는 방법이 있음
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답변
김중재님의 답변
2015-08-18- 1
이미 동정하여 확인한 미생물이라 하셨으니
그 때 사용한 동정 방법을 이용해 같은 미생물인지 확인할 수있습니다.
아마 그 방법이 16S rRNA gene sequence 결정이었으리라 생각이 됩니다.
Colony PCR 을 하시던 genomic DNA 를 분리하여 PCR 을 하시던 관계없이
16S Universal primers 로 PCR 증폭을 하신 뒤
그 DNA 의 염기서열을 결정하여 비교해 보시면 됩니다.
중앙대학교에 계시면 생명과학과의 전체옥 교수님 연구실에 모든 것이 준비되어 있을 겁니다.
혹 본인의 연구실에 그러한 장비/시약/경험이 없으면 그 쪽에 한 번 문의해 보세요.
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이상후님의 답변
2015-08-20- 1
외부 의뢰기관 한 곳 추천해 드립니다.
한국종균협회 부설 미생물보존센터(서울 서대문구 위치), 보통 KCCM 이라고 합니다.
여기는 미생물 동정 항목이 약 14가지가 있는데, kit를 이용한 가장 간단한 방법부터 16S rRNA sequencing까지 의뢰자가 지정하여 분석 의뢰할 수 있습니다. 하지만 각 항목별로 비용이 소요됩니다.
http://www.kccm.or.kr/