2015-12-02
org.kosen.entty.User@9bac730
장미옥(bestwife76)
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Taxus spp. cell culture를 통해 어떤 물질을 확보했습니다
참고로 저는 chemical compound에 대해서는 문외한입니다.
이 물질의 분자량은 685이고 retention time이 40분대 이상인 매우 비극성 compound입니다
이 물질에 대한 정보라고는 분자량과 비극성이라는 것 Taxus spp에서 나왔다는 것 뿐입니다
이 물질이 어떤 물질인지 찾아낼 수 있는 방법이 있을까요?
이를테면 Taxus spp. 내 포함된 물질에 대한 database가 있어서 그 DB에서 분자량 만으로 찾아낼 수 있다든지 혹은 굳이 Taxus spp DB가 아니더라도 분자량 만으로 물질에 대한 정보를 찾아낼 수 있다든지 하는 것입니다
가장 정확한 것은 NMR을 통해 구조 동정을 하면 바로 알 수 있지만 샘플 준비를 해야 하고 NMR도 녹록치 않은 작업이라고 들었습니다
이 물질이 무엇인지 찾아낼 수 있는 방법은 무엇일까요?
참고로 저는 chemical compound에 대해서는 문외한입니다.
이 물질의 분자량은 685이고 retention time이 40분대 이상인 매우 비극성 compound입니다
이 물질에 대한 정보라고는 분자량과 비극성이라는 것 Taxus spp에서 나왔다는 것 뿐입니다
이 물질이 어떤 물질인지 찾아낼 수 있는 방법이 있을까요?
이를테면 Taxus spp. 내 포함된 물질에 대한 database가 있어서 그 DB에서 분자량 만으로 찾아낼 수 있다든지 혹은 굳이 Taxus spp DB가 아니더라도 분자량 만으로 물질에 대한 정보를 찾아낼 수 있다든지 하는 것입니다
가장 정확한 것은 NMR을 통해 구조 동정을 하면 바로 알 수 있지만 샘플 준비를 해야 하고 NMR도 녹록치 않은 작업이라고 들었습니다
이 물질이 무엇인지 찾아낼 수 있는 방법은 무엇일까요?
- Taxus spp
- Molecular weight
- compound
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 4
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답변
김동현님의 답변
2015-12-02- 2
제일 간단한 방법은 Taxus spp에 관련된 논문을 많이 찾아보시고 이전에 분리된 물질과 비교해주시는 것입니다. 만약 어려우시다면 여러 MS 데이터 베이스를 이용하실 수 있지만 만약 accurate mass가 아니라면 수많은 isomer 때문에 물질 동정하기가 쉽지 않을거라 생각됩니다.
혹시 아래 Plant Metabolic Network 이용해보시기 바랍니다.
http://www.plantcyc.org/
또는 mass spec database인 https://metlin.scripps.edu/index.php 도 이용해보시기 바랍니다. -
답변
조윤환님의 답변
2015-12-02- 2
반갑습니다.
아마도 분자량을 확인하셨다면 LC/MS로 확인하셨으리라 짐작 합니다.
가장 좋은 방법은 LC/MS 데이타로 부터 구조에 대한 정보를 확인하여 타겟의 범위를 좀더 좁이는 노력이 필요합니다.
MS분석은 극미량의 시료로도 분석이 가능하므로 적합한 분석법이라 생각합니다.
필요하다면 tandem MS를 통해 보다 구체적인 구조정보를 얻을 수도 있습니다.
기초과학연구원 Mass group에 도움을 받으신다면 좋을 것 같네요.
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답변
이상후님의 답변
2015-12-08- 2
혹시 SciFinder가 설치되어 있다면, 키워드로 Taxus species, MW 685 로 검색을 시도해 보시기 바랍니다. -
답변
조익수님의 답변
2015-12-09- 2
물질 구조 분석은 여러가지 분석장비를 통해 종합하여 결론내는게 가장 효율적입니다.
일반적으로 Unknown sample을 분석하는 경우는 NMR을 통해 proton과 carbon을 분석하고,
MS를 통해 분자량 확보, 이 후 IR을 통해 bonding을 확인합니다.
하지만 complex compound(분자량 500혹은 1000이상)의 경우엔 위 방법을 통해 알기가
쉽지 않습니다. 다만, 분자량이 685정도이고 Nonpolar compound라면 GC/MS를 통해 분석하는걸
추천드립니다. 일반적으로 GC에서 검출이 가능하다면 GC/MS의 경우 library가 존재하기때문에
fragment pattern을 통해 유사 물질 후보군을 검색할 수 있습니다.
많은 도움이 되셨길 바랍니다..