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지식나눔

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Genomic DNA를 whole genome amplification 후, QC어떻게 해야 할까요?

2015-12-03 org.kosen.entty.User@5f2b596a 김주혁(kjh5703)
  • 2
쓸만한 kit이나, 혹은 방법이 없나요?
  • qc
  • whole genome amplification
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답변 2
  • 답변

    장성재님의 답변

    2015-12-03
    • 2

    첨부파일

    첨부한 논문을 참고하세요.
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    첨부한 논문을 참고하세요.
    김주혁(kjh5703) 2015-12-03

    좋은 논문 고맙습니다. 이거 말고, 다른 논문이나 Protocol은 없을까요? 여건 상 찾기 어려워서...

  • 답변

    김용규님의 답변

    2015-12-03
    • 1

    whole genome amplification 에는 기본적으로 PCR 기반의 Degenerate Oligonucleotide PCR (DOP-PCR)와  Primer Extension Preamplification (PEP), 일정 온도에서 amplification이 진행되는 Multiple Displacement Amplification (MDA)가 있습니다.  일반적으로 MDA가 더 큰 amplified product를 생산하고 에러도 더 적은 것으로 알려져 있습니다. 

    퀴아젠에서 kit이 나오고 있는데 NEB나 다른 메이져 회사들에서 kit가 있는 걸로 알고 있습니다.  
    https://www.qiagen.com/qdm/aw/sgc/repli-g?cmpid=QVenGA16RepliG
     
    Amplicifacation efficiency는 qPCR이나 agarose gel을 통해 qualitative하게 확인할 수 있습니다. 

     

    답변수정

    whole genome amplification 에는 기본적으로 PCR 기반의 Degenerate Oligonucleotide PCR (DOP-PCR)와  Primer Extension Preamplification (PEP), 일정 온도에서 amplification이 진행되는 Multiple Displacement Amplification (MDA)가 있습니다.  일반적으로 MDA가 더 큰 amplified product를 생산하고 에러도 더 적은 것으로 알려져 있습니다. 

    퀴아젠에서 kit이 나오고 있는데 NEB나 다른 메이져 회사들에서 kit가 있는 걸로 알고 있습니다.  
    https://www.qiagen.com/qdm/aw/sgc/repli-g?cmpid=QVenGA16RepliG
     
    Amplicifacation efficiency는 qPCR이나 agarose gel을 통해 qualitative하게 확인할 수 있습니다. 

     

    김영지(yj900423) 2016-01-24

    좋은정보 감사합니다.

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