2016-03-21
org.kosen.entty.User@37bd56d7
강경인(kyoungin90)
- 1
안녕하세요.
제가 lambda dna를 yoyo로 염색하려고 하는데
많은 논문들에서 "dye per base pair ratio 1:10 " 비율로
염색했다고 나옵니다.
그런데 실험할땐 염색약과 dna의 농도로 계산해야 되는데.
이걸 몰수로 계산해서 하는걸까요??
생물분야를 많이 접해보지 않아서 확신이 않아서 도움요청드립니다.
제가 lambda dna를 yoyo로 염색하려고 하는데
많은 논문들에서 "dye per base pair ratio 1:10 " 비율로
염색했다고 나옵니다.
그런데 실험할땐 염색약과 dna의 농도로 계산해야 되는데.
이걸 몰수로 계산해서 하는걸까요??
생물분야를 많이 접해보지 않아서 확신이 않아서 도움요청드립니다.
- dna 염색
- lambda dna
- yoyo
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 1
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답변
배소현님의 답변
2016-03-22- 2
첨부파일
Question : How can I calculate the DNA bp: dye ratio?I have YOYO-1 dye and I want to add dye at 5:1 ratio. And I am using a plasmid of length 5411 bp. Please tell me how to calculate this ratio to get a volume of dye to be added to DNA of 1 microgram.
Answer :
If you mean molar ratio, you have to calculate the molar amount of 1 ug of 5411 bp DNA. It can be easily approximated with 660 g/mol per base pair, i.e. 1 ug of 5411 bp corresponds to 0.000001/(5411x660)=0.28 pmol. However, in your experiment you need to keep constant ratio of the dye per base pair, so the length is not important here and you just calculate 0.000001/660=1.5 nmol (of base pairs). So you need to add 7.5 nmol of the dye.
저도 찾아본 자료지만 답변 감사드립니다!ㅎ