2016-10-06
org.kosen.entty.User@726c8bc8
양현모(yymomo)
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표시 질문입니다.
문헌을 보다보니 HDAC6 +/+ , HDAC6 -/- 로 되어 있어서요
- /- 은 knock out을 말하는 것 같은데요? 아닌가요
그럼 knock down은 어떻게 표시하나요?
문헌을 보다보니 HDAC6 +/+ , HDAC6 -/- 로 되어 있어서요
- /- 은 knock out을 말하는 것 같은데요? 아닌가요
그럼 knock down은 어떻게 표시하나요?
- knockout
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답변 2
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답변
김의준님의 답변
2016-10-06- 2
+/+, -/- 등은 유전형에서 쓰는 단위입니다.
그래서 유전자 두세트가 사라졌을 경우 -/-, 헤테로인 경우 +/- 라고도 표시하게 됩니다.
하지만 knock down의 경우에는 유전자가 사라지지 않고,
siRNA 등으로 발현을 줄인것에 해당하기 때문에 유전형 자체는 변하지 않습니다.
굳이 표현하는 걸 보면 KD 라거나 siRNA, 혹은 shRNA 등으로 표시하게 됩니다.
물론 -/- 에다가 다시 origin이 되는 단백질을 발현하거나, mutant를 발현시키기도 하니까, 더 복잡한 모델을 만들거나 할 수는 있습니다. -
답변
윤창호님의 답변
2016-10-07- 1
크로모좀 상에서 HDAC6 유전자 부위가 모두 정상적으로 존재하는 경우 HDAC6 +/+ 즉 Wild type으로 표시하고
HDAC6 유전자 발현이 안되도록 특정부위가 deletion되어 완전히 발현이 없어질 경우 -/-로 표시하는 knock-out (KO)로 표현합니다. 윗분 말씀대로 knock down은 다양한 방법으로 유전자 발현을 줄일 수 있으며 HDAC6 발현을 줄이기 위해 siRNA를 사용했다면 HDAC6 siRNA라고 표시할 수 도 있으며 단백질 발현의 감소를 western blot으로 감소된 수준을 확인하기도 합니다. 물론 KO 마우스의 경우도 genotype 뿐만 아니라 WB으로 단백질 수준까지 검증하긴 함니다만,
저도 정확히 알고 갑니다 감사합니다