지식나눔

바이러스 중화 검증

안녕하세요
바이러스 detection을 위해 RT-PCR를 많이 사용하더라구요
바이러스 백신의 중화효능을 검증하기 위한 방법으로도 RT-PCR을 많이 사용하나요?
보통 백신중화효능 검증방법으로 PRNT나 ELISA를 많이 사용한다고 알고 있습니다.
이것을 RT-PCR level로도 검증을 많이 사용하는지 궁금합니다.
문헌을 찾고 있는데, 모두 그냥 바이러스 detection RT-PCR 자료밖에 못찾아서 질문 올립니다.ㅠ
감사합니다.
  • 바이러스
  • 중화능 검증
  • RT-PCR
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답변 2
  • 답변

    서기원님의 답변

    RT-PCR을 이용한 중화효능 검증은 일반적으로 사용하지 않습니다. 최소한 제가 지끔까지 본 논문에서는 단 1건도 기억나지 않습니다만, 극 소수 있었으나 기억하지 못할 수 도 있습니다.
    그렇다고 assay 방법의 설계에 따라 불가능하지는 않을 것으로 생각됩니다.

    다만, 비효율적이라는 생각이 되는군요..
    중화효능을 보기 위해서는 여러개의 샘플을 여러 농도에서 복수로 수행해야 하는데, 모든 샘플의 RNA를 각각 분리하고, PCR을 수행하고 하는 일이 더 어렵고 노력이 들어갑니다. 값의 variation도 클수 있고요.
    CPE의 유무, 적절한 검출항체 유무, 세포주, virus 증식 시간 등 다양한 조건에 따라 기존의 방법들을 응용하거나 modification을 통하여 대부분의 바이러스는 무리 없이 기존의 방법으로 측정가능합니다.
    이미 손쉽게 측정할 방법이 있는데 굳이 더 어려운 다른 방법을 사용할 이유는 없습니다. 굳이 RT-PCR을 사용해야할 이유가 있는지요?

    또한, 평가 assay는 validation이 매우 중요합니다.  실험 방법의 적확성, 측정한 값의 실뢰도 등에서 연구자 혹은 다른 사람들이 타당하다고 생각하며 믿을 수 있어야 합니다. 보통의 assay방법들은 이런 것을 기반으로 오랫 시간동안 여러 연구결과가 축적되어 구축됩니다. 통계학적, 실험적 타당성에도 근거를 두고요. 새로은 assay를 통해 증명하고자 한다면, 이러한 부분들에 대해서 연구자 본인이 많은 보충 결과를 제출해야 할 것으로 보입니다.

    추가로 실제 수행한 연구자나 다른 평가자, 구독자 등도 결과를 보고 다른 연구 결과와 절대 및 상대 비교도 해야할 필요도 있겠지요? 그렇다면 동일 혹은 유사한 실험방법들을 적용하는 것이 유리하겠지요. 

    단순 연구만이 목적이 아니라, 만일 백신 개발 및 제품화(인허가)에 목적을 두고 계신다면 더욱이 그렇습니다.
    RT-PCR을 이용한 중화효능 검증은 일반적으로 사용하지 않습니다. 최소한 제가 지끔까지 본 논문에서는 단 1건도 기억나지 않습니다만, 극 소수 있었으나 기억하지 못할 수 도 있습니다.
    그렇다고 assay 방법의 설계에 따라 불가능하지는 않을 것으로 생각됩니다.

    다만, 비효율적이라는 생각이 되는군요..
    중화효능을 보기 위해서는 여러개의 샘플을 여러 농도에서 복수로 수행해야 하는데, 모든 샘플의 RNA를 각각 분리하고, PCR을 수행하고 하는 일이 더 어렵고 노력이 들어갑니다. 값의 variation도 클수 있고요.
    CPE의 유무, 적절한 검출항체 유무, 세포주, virus 증식 시간 등 다양한 조건에 따라 기존의 방법들을 응용하거나 modification을 통하여 대부분의 바이러스는 무리 없이 기존의 방법으로 측정가능합니다.
    이미 손쉽게 측정할 방법이 있는데 굳이 더 어려운 다른 방법을 사용할 이유는 없습니다. 굳이 RT-PCR을 사용해야할 이유가 있는지요?

    또한, 평가 assay는 validation이 매우 중요합니다.  실험 방법의 적확성, 측정한 값의 실뢰도 등에서 연구자 혹은 다른 사람들이 타당하다고 생각하며 믿을 수 있어야 합니다. 보통의 assay방법들은 이런 것을 기반으로 오랫 시간동안 여러 연구결과가 축적되어 구축됩니다. 통계학적, 실험적 타당성에도 근거를 두고요. 새로은 assay를 통해 증명하고자 한다면, 이러한 부분들에 대해서 연구자 본인이 많은 보충 결과를 제출해야 할 것으로 보입니다.

    추가로 실제 수행한 연구자나 다른 평가자, 구독자 등도 결과를 보고 다른 연구 결과와 절대 및 상대 비교도 해야할 필요도 있겠지요? 그렇다면 동일 혹은 유사한 실험방법들을 적용하는 것이 유리하겠지요. 

    단순 연구만이 목적이 아니라, 만일 백신 개발 및 제품화(인허가)에 목적을 두고 계신다면 더욱이 그렇습니다.
    DELETED(seyul2) 2018-06-18

    답변감사합니다!

  • 답변

    변경필님의 답변

    바이러스 중화관련 RT-(q)PCR 시험이 활발히 이루어지고 있습니다.
    참고 자료와 관련 링크를 보내드립니다.
    (관련 논문 많이 있습니다)
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5672142/
    https://www.nature.com/articles/srep25141
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352396417300932
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0264410X15015662
    바이러스 중화관련 RT-(q)PCR 시험이 활발히 이루어지고 있습니다.
    참고 자료와 관련 링크를 보내드립니다.
    (관련 논문 많이 있습니다)
    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5672142/
    https://www.nature.com/articles/srep25141
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352396417300932
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0264410X15015662
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