2018-07-12
org.kosen.entty.User@5fc0d092
손영옥(sounagi1)
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Primer design 어떻게 하시고 계시나요?
좋은 프로그램 또는 웹사이트 알고 계시면 공유 부탁드립니다.
좋은 프로그램 또는 웹사이트 알고 계시면 공유 부탁드립니다.
- Primer
- RT-PCR
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 4
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답변
김형택님의 답변
2018-07-17- 3
저는 Primer3을 사용했습니다. 링크 걸어드립니다.
http://bioinfo.ut.ee/primer3-0.4.0/ -
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심우영님의 답변
2018-07-27- 0
Primer Design and Search Tool도 쓸만 합니다.
링크 걸어드립니다.
http://bisearch.enzim.hu/?m=search -
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임창임님의 답변
2018-08-07- 0
원하는 유전자의 mRNA 서열을 NCBI의 "Gene"에서 검색한 후 오른쪽 패널에 primer 디자인이 연결되어 있습니다
"Pick Primers"를 클릭하시면 다양한 조건을 바탕으로 프라이머를 제작하실 수 있습니다.
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답변
서준배님의 답변
2018-11-19- 0
프로그램이나 웹사이트를 사용하는 것도 한 방법이지만 저는 직접 프라이머를 디자인 합니다.
제가 직접 프라이머를 짤 때는 qPCR을 할때 인데, 저는 엑손 내에서 프라이머를 디자인 하지 않고, 엑손과 엑손의 정션에서 프라이머를 디자인 합니다. 이렇게 프라이머를 디자인 할 경우 genomic DNA 오염된 것을 배제 시킬 수 있습니다. 예를 들어, 어떤 유전자의 발현양을 보기 위해서 엑손 3 안에서 5' 와 3' 의 프라이머를 디자인 할 경우, cDNA와 genomic DNA가 오염된 모든 경우에서 시그널이 생깁니다. 그래서 이런 경우를 배제하기 위해서 5'은 엑손 3에서 3'은 엑손 3과 4 정션에서 프라이머를 디자인 합니다.
인터넷에으로 검색해보시면 직접 프라이머를 짤 때 고려해야 할 점들을 쉽게 찾을 수 있습니다.
저는 여기 프로그램에 한 표 드립니다.